SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 1

同義遺伝子名

SNF2L, Probable global transcription activator SNF2L1, SMARCA1, SWI2, ISWI, ATP-dependent helicase SMARCA1, NURF140, SNF2LB, Nucleosome remodeling factor subunit SNF2L, SNF2L1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:22.50

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:237.30

目:58.80

動脈:60

静脈:66.60

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:40.30

骨:51.20

皮膚:19.20

GeneChip

大脳:6.19

小脳:6.29

脳幹:6.82

脳梁:6.14

松果体:-

末梢神経:7.37

脊柱:7.01

網膜:-

目:-

動脈:6.80

静脈:6.26

リンパ節:5.30

末梢血:-

脾臓:5.36

胸腺:5.40

骨髄:3.89

脂肪:6.29

骨:-

皮膚:5.40

CAGE

大脳:3.37

小脳:-

脳幹:3.42

脳梁:3.02

松果体:3.62

末梢神経:-

脊柱:3.70

網膜:-

目:-

動脈:3.30

静脈:2.86

リンパ節:1.96

末梢血:-

脾臓:2.93

胸腺:1.75

骨髄:-

脂肪:2.91

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.93

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.01

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.14

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:54.70

胎盤:7.30

前立腺:78.90

卵巣:186.30

精巣:56.20

心臓:63.90

骨格筋:40.20

食道:-

胃:42.50

腸:32.40

結腸:8.50

肝臓:21.10

肺:39.10

膀胱:-

腎臓:93.60

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:62.20

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.48

胎盤:7.28

前立腺:8.08

卵巣:7.76

精巣:8.30

心臓:6.65

骨格筋:6.04

食道:5.51

胃:6.54

腸:6.28

結腸:5.23

肝臓:7.61

肺:6.32

膀胱:-

腎臓:6.29

下垂体:8.18

甲状腺:7.86

副腎:8.33

膵臓:6.49

乳腺:6.12

唾液腺:6.22

CAGE

子宮:3.56

胎盤:3.54

前立腺:4.15

卵巣:4.25

精巣:4.58

心臓:3.50

骨格筋:2.94

食道:3.23

胃:-

腸:2.33

結腸:2.82

肝臓:3.88

肺:3.28

膀胱:3.78

腎臓:3.43

下垂体:4.32

甲状腺:3.90

副腎:-

膵臓:2.41

乳腺:3.40

唾液腺:2.75

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.11

卵巣:4.25

精巣:4.83

心臓:3.45

骨格筋:2.76

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.40

肝臓:2.99

肺:3.65

膀胱:-

腎臓:3.83

下垂体:-

甲状腺:4.80

副腎:2.84

膵臓:-

乳腺:2.03

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_139035
Gene ID	6594
Unigene ID	Hs.152292
Probe set ID	203874_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000102038
GTEx ID	ENSG00000102038

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_053123
ラット[1]	NM_053123

染色体

Xq25 [128,580,480 - 128,657,477]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related
IPR001005	SANT, DNA-binding

GO:0043044	ATP-dependent chromatin remodeling
GO:0007420	brain development
GO:0006338	chromatin remodeling
GO:0000733	DNA strand renaturation
GO:0030182	neuron differentiation
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

GO:0000790	nuclear chromatin
GO:0005634	nucleus
GO:0016589	NURF complex

GO:0005524	ATP binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0008094	DNA-dependent ATPase activity
GO:0004386	helicase activity
GO:0031491	nucleosome binding
GO:0070615	nucleosome-dependent ATPase activity
GO:0005515	protein binding

SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function