SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2

同義遺伝子名

Sth1p, SNF2L2, ATP-dependent helicase SMARCA2, SNF2A, BAF190, SMARCA2, FLJ36757, BRM, MGC74511, Probable global transcription activator SNF2L2, hBRM, SNF2LA, hSNF2a, SNF2-alpha

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:94.80

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:148.30

末梢神経:122.70

脊柱:-

網膜:237.30

目:182.20

動脈:30

静脈:-

リンパ節:182

末梢血:-

脾臓:75.60

胸腺:103.10

骨髄:59

脂肪:201.70

骨:38.40

皮膚:100.80

GeneChip

大脳:6.74

小脳:7.02

脳幹:6.47

脳梁:5.93

松果体:-

末梢神経:6.50

脊柱:6.43

網膜:-

目:-

動脈:6.13

静脈:6.22

リンパ節:6.17

末梢血:-

脾臓:6.54

胸腺:6.65

骨髄:5.83

脂肪:6.56

骨:-

皮膚:6.11

CAGE

大脳:4.34

小脳:-

脳幹:4.07

脳梁:3.96

松果体:4.04

末梢神経:-

脊柱:4.11

網膜:-

目:-

動脈:4.37

静脈:4.10

リンパ節:4.02

末梢血:-

脾臓:3.94

胸腺:3.69

骨髄:-

脂肪:3.97

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.24

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.15

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.91

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:91.10

胎盤:94.70

前立腺:146.40

卵巣:298.10

精巣:82.20

心臓:178.80

骨格筋:60.30

食道:-

胃:85

腸:32.40

結腸:76.30

肝臓:52.80

肺:83.10

膀胱:-

腎臓:104

下垂体:232

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:142.30

乳腺:223

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.95

胎盤:6.17

前立腺:7.18

卵巣:7.54

精巣:7.33

心臓:6.45

骨格筋:6.56

食道:6.24

胃:6.10

腸:6.18

結腸:5.92

肝臓:5.62

肺:6.32

膀胱:-

腎臓:6.17

下垂体:7.08

甲状腺:6.55

副腎:6.29

膵臓:5.88

乳腺:6.71

唾液腺:6.52

CAGE

子宮:4.24

胎盤:3.88

前立腺:4.06

卵巣:4.76

精巣:4.31

心臓:3.82

骨格筋:3.83

食道:3.94

胃:-

腸:3.65

結腸:3.50

肝臓:3.24

肺:3.96

膀胱:4.07

腎臓:3.56

下垂体:4.46

甲状腺:3.75

副腎:-

膵臓:3.34

乳腺:4.00

唾液腺:4.08

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.97

卵巣:2.51

精巣:2.75

心臓:0.69

骨格筋:2.55

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.41

肝臓:1.50

肺:1.31

膀胱:-

腎臓:1.25

下垂体:-

甲状腺:2.66

副腎:1.29

膵臓:-

乳腺:2.26

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003070
Gene ID	6595
Unigene ID	Hs.298990
Probe set ID	206544_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000080503
GTEx ID	ENSG00000080503

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_011416, NM_026003
ラット[1]	NM_001004446, NM_026003

染色体

9p24.3 [2,015,342 - 2,193,624]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR013999	HAS subgroup
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain
IPR014012	Helicase/SANT-associated, DNA binding
IPR006562	HSA

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006338	chromatin remodeling
GO:0030308	negative regulation of cell growth
GO:0008285	negative regulation of cell proliferation
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007399	nervous system development
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0045111	intermediate filament cytoskeleton
GO:0043231	intracellular membrane-bounded organelle
GO:0000790	nuclear chromatin
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0016514	SWI/SNF complex

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0008094	DNA-dependent ATPase activity
GO:0004386	helicase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0003713	transcription coactivator activity

SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function