SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily b, member 1

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同義遺伝子名

Sfh1p, SNF5, hSNF5, Snr1, SNF5L1, Integrase interactor 1 protein, SMARCB1, RDT, INI1, hSNFS, Ini1, BAF47

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:53.30

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:355.90

目:123.40

動脈:89.90

静脈:66.60

リンパ節:40.40

末梢血:54.70

脾臓:18.90

胸腺:64.40

骨髄:39.40

脂肪:-

骨:25.60

皮膚:100.80

GeneChip

大脳:7.05

小脳:7.50

脳幹:7.10

脳梁:7.08

松果体:-

末梢神経:7.03

脊柱:7.10

網膜:-

目:-

動脈:6.88

静脈:6.89

リンパ節:7.67

末梢血:-

脾臓:7.47

胸腺:7.58

骨髄:7.12

脂肪:7.06

骨:-

皮膚:7.38

CAGE

大脳:3.89

小脳:-

脳幹:3.69

脳梁:3.89

松果体:4.11

末梢神経:-

脊柱:3.73

網膜:-

目:-

動脈:3.35

静脈:3.86

リンパ節:3.92

末梢血:-

脾臓:3.61

胸腺:4.24

骨髄:-

脂肪:3.28

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.96

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.85

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.21

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:27.30

胎盤:171.20

前立腺:90.10

卵巣:111.80

精巣:69.20

心臓:76.60

骨格筋:40.20

食道:-

胃:21.20

腸:64.80

結腸:84.80

肝臓:10.60

肺:78.20

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:101.60

膵臓:8.90

乳腺:120.80

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.44

胎盤:8.43

前立腺:7.23

卵巣:7.55

精巣:8.47

心臓:6.80

骨格筋:6.69

食道:7.42

胃:7.13

腸:7.24

結腸:7.52

肝臓:6.95

肺:6.80

膀胱:-

腎臓:7.27

下垂体:7.38

甲状腺:7.32

副腎:7.11

膵臓:7.03

乳腺:7.43

唾液腺:7.25

CAGE

子宮:3.48

胎盤:3.93

前立腺:3.49

卵巣:3.97

精巣:4.62

心臓:3.62

骨格筋:3.31

食道:3.48

胃:-

腸:3.41

結腸:3.64

肝臓:3.42

肺:3.57

膀胱:3.06

腎臓:3.69

下垂体:3.97

甲状腺:3.51

副腎:-

膵臓:3.61

乳腺:3.49

唾液腺:3.45

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.37

卵巣:4.88

精巣:3.92

心臓:2.89

骨格筋:3.37

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.29

肝臓:1.97

肺:2.67

膀胱:-

腎臓:3.35

下垂体:-

甲状腺:3.75

副腎:4.20

膵臓:-

乳腺:3.59

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003073
Gene ID	6598
Unigene ID	Hs.534350
Probe set ID	212167_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000099956
GTEx ID	ENSG00000099956

オーソログ対応遺伝子

マウス[8]	NM_001161853, NM_011418
ラット [0]

染色体

22q11.23 [24,129,150 - 24,176,703]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006939	SNF5/SMARCB1/INI1
IPR017393	SWI/SNF chromatin-remodeling complex, component hSNF5/Ini1

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0043044	ATP-dependent chromatin remodeling
GO:0001835	blastocyst hatching
GO:0030154	cell differentiation
GO:0006338	chromatin remodeling
GO:0015074	DNA integration
GO:0006281	DNA repair
GO:0008285	negative regulation of cell proliferation
GO:0007399	nervous system development
GO:0006337	nucleosome disassembly
GO:0043923	positive regulation by host of viral transcription
GO:0051091	positive regulation of transcription factor activity
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045090	retroviral genome replication
GO:0006351	transcription, DNA-dependent
GO:0019048	virus-host interaction

Cellular Component

GO:0000228	nuclear chromosome
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0016514	SWI/SNF complex
GO:0001741	XY body

Molecular Function

GO:0002039	p53 binding
GO:0005515	protein binding
GO:0030957	Tat protein binding
GO:0003713	transcription coactivator activity

SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily b, member 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function