sphingomyelin phosphodiesterase 2, neutral membrane (neutral sphingomyelinase)

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同義遺伝子名

nSMase, NSMASE, Lyso-PAF-PLC, Neutral sphingomyelinase, Lyso-platelet-activating factor-phospholipase C, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, SMPD2, N-SMase

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:9.50 小脳:- 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:64.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:70.80 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:-
GeneChip 大脳:5.61 小脳:5.52 脳幹:5.52 脳梁:5.75 松果体:- 末梢神経:5.74 脊柱:5.72 網膜:- 目:- 動脈:6.26 静脈:5.98 リンパ節:6.67 末梢血:- 脾臓:6.21 胸腺:6.28 骨髄:6.41 脂肪:6.12 骨:- 皮膚:6.63
CAGE 大脳:1.73 小脳:- 脳幹:1.70 脳梁:2.51 松果体:1.62 末梢神経:- 脊柱:1.72 網膜:- 目:- 動脈:2.12 静脈:3.02 リンパ節:2.77 末梢血:- 脾臓:2.48 胸腺:2.87 骨髄:- 脂肪:2.07 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.82 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.14 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.37 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:3.60 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:30.30 心臓:38.30 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:32.40 結腸:17     肝臓:-        肺:14.70    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:8.90 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.04 胎盤:6.51 前立腺:6.36 卵巣:6.30 精巣:7.93 心臓:5.68 骨格筋:5.82 食道:7.02 胃:6.06 腸:6.31 結腸:6.23 肝臓:5.72 肺:6.36 膀胱:- 腎臓:6.06 下垂体:6.11 甲状腺:6.29 副腎:5.93 膵臓:6.90 乳腺:6.36 唾液腺:7.32
CAGE 子宮:2.26 胎盤:3.03 前立腺:2.35 卵巣:2.05 精巣:3.45 心臓:2.05 骨格筋:1.24 食道:2.66 胃:- 腸:2.88 結腸:3.05     肝臓:2.07    肺:2.56 膀胱:2.00 腎臓:2.47 下垂体:1.80 甲状腺:2.44 副腎:- 膵臓:2.81 乳腺:2.11 唾液腺:3.03
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.46 卵巣:2.03 精巣:3.84 心臓:0.76 骨格筋:1.18 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.31     肝臓:1.36        肺:2.47    膀胱:- 腎臓:2.25 下垂体:- 甲状腺:2.38 副腎:2.17 膵臓:- 乳腺:1.57 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003080
Gene ID 6610
Unigene ID Hs.55235
Probe set ID 205622_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000135587
GTEx ID ENSG00000135587

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_009213
ラット[1]  NM_031360

染色体

6q21  [109,761,966  -  109,765,122]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
9520418
10608884
11238738
11997500
12477932
12566438
12676795
14689449
15013522
15051724
15175033
15489334
15509740
16344560
17207965
17212982
17272284
17344303
17449104
18040843
18391951
19698806
19817993
19834535
19913121
20378749
20448054
20628086
20836852
21335555
21906983
22721673
22899568

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0046513  ceramide biosynthetic process
GO:0006687  glycosphingolipid metabolic process
GO:0048011  nerve growth factor receptor signaling pathway
GO:0007243  protein kinase cascade
GO:0009612  response to mechanical stimulus
GO:0006665  sphingolipid metabolic process
GO:0006684  sphingomyelin metabolic process

Cellular Component

GO:0005901  caveola
GO:0005887  integral to plasma membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0046872  metal ion binding
GO:0004767  sphingomyelin phosphodiesterase activity