snail homolog 1 (Drosophila)

同義遺伝子名

Zinc finger protein SNAI1, SNAI1, Protein sna, SNAH, SNA, SLUGH2, dJ710H13.1, snail homolog 1 (Drosophila), Protein snail homolog

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:4.70

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:35.30

動脈:89.90

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:91.10

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:51.20

皮膚:-

GeneChip

大脳:5.04

小脳:5.05

脳幹:5.12

脳梁:5.05

松果体:-

末梢神経:4.99

脊柱:5.01

網膜:-

目:-

動脈:5.28

静脈:5.59

リンパ節:4.92

末梢血:-

脾臓:4.85

胸腺:4.51

骨髄:5.01

脂肪:5.31

骨:-

皮膚:5.24

CAGE

大脳:0.97

小脳:-

脳幹:1.01

脳梁:1.80

松果体:0.92

末梢神経:-

脊柱:1.91

網膜:-

目:-

動脈:3.17

静脈:2.13

リンパ節:1.45

末梢血:-

脾臓:2.05

胸腺:0.46

骨髄:-

脂肪:2.78

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.71

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.06

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.84

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:51

前立腺:-

卵巣:-

精巣:13

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:8.50

肝臓:10.60

肺:24.40

膀胱:-

腎臓:10.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.86

胎盤:5.82

前立腺:4.68

卵巣:4.73

精巣:4.81

心臓:5.36

骨格筋:5.32

食道:5.03

胃:4.81

腸:5.18

結腸:5.13

肝臓:5.11

肺:5.44

膀胱:-

腎臓:4.92

下垂体:4.86

甲状腺:5.28

副腎:5.34

膵臓:5.36

乳腺:4.93

唾液腺:5.04

CAGE

子宮:1.61

胎盤:2.57

前立腺:1.86

卵巣:1.89

精巣:1.73

心臓:2.19

骨格筋:1.13

食道:1.50

胃:-

腸:1.05

結腸:0.96

肝臓:1.81

肺:2.77

膀胱:1.95

腎臓:1.40

下垂体:1.21

甲状腺:2.72

副腎:-

膵臓:0.58

乳腺:2.19

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.55

卵巣:1.43

精巣:1.59

心臓:0.55

骨格筋:0.87

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.60

肝臓:0.88

肺:3.57

膀胱:-

腎臓:1.24

下垂体:-

甲状腺:1.70

副腎:2.79

膵臓:-

乳腺:1.49

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005985
Gene ID	6615
Unigene ID	Hs.48029
Probe set ID	219480_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000124216
GTEx ID	ENSG00000124216

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_011427
ラット[1]	NM_053805

染色体

20q13.13 [48,599,536 - 48,605,423]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR015880	Zinc finger, C2H2-like
IPR007087	Zinc finger, C2H2-type

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0060536	cartilage morphogenesis
GO:0016477	cell migration
GO:0001837	epithelial to mesenchymal transition
GO:0031069	hair follicle morphogenesis
GO:0060972	left/right pattern formation
GO:0001707	mesoderm formation
GO:0060806	negative regulation of cell differentiation involved in embryonic placenta development
GO:0043518	negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0010957	negative regulation of vitamin D biosynthetic process
GO:0001649	osteoblast differentiation
GO:0060021	palate development
GO:0030335	positive regulation of cell migration
GO:0010718	positive regulation of epithelial to mesenchymal transition
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0060707	trophoblast giant cell differentiation

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0019900	kinase binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0005515	protein binding
GO:0043565	sequence-specific DNA binding

snail homolog 1 (Drosophila)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function