small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1

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同義遺伝子名

COD, SNRPB, snRNP-B, SmB/SmB', Sm protein B/B', SNRPB1, Sm-B/Sm-B'

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:54.50

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:116.60

松果体:148.30

末梢神経:61.30

脊柱:112.30

網膜:-

目:188.10

動脈:119.90

静脈:133.30

リンパ節:202.20

末梢血:164

脾臓:37.80

胸腺:64.40

骨髄:78.70

脂肪:363

骨:64

皮膚:48

GeneChip

大脳:7.49

小脳:8.31

脳幹:7.47

脳梁:7.33

松果体:-

末梢神経:7.91

脊柱:7.57

網膜:-

目:-

動脈:8.41

静脈:8.52

リンパ節:8.92

末梢血:-

脾臓:8.72

胸腺:9.49

骨髄:9.25

脂肪:8.69

骨:-

皮膚:9.12

CAGE

大脳:2.91

小脳:-

脳幹:2.69

脳梁:2.57

松果体:2.79

末梢神経:-

脊柱:2.65

網膜:-

目:-

動脈:3.50

静脈:3.76

リンパ節:3.80

末梢血:-

脾臓:3.72

胸腺:4.06

骨髄:-

脂肪:3.34

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.07

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.64

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.85

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:91.10

胎盤:80.10

前立腺:67.60

卵巣:111.80

精巣:26

心臓:191.60

骨格筋:40.20

食道:-

胃:-

腸:32.40

結腸:67.80

肝臓:10.60

肺:151.50

膀胱:-

腎臓:52

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:160

乳腺:46.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.63

胎盤:9.09

前立腺:8.81

卵巣:8.74

精巣:9.08

心臓:8.15

骨格筋:8.27

食道:9.45

胃:8.32

腸:8.79

結腸:9.07

肝臓:7.62

肺:8.76

膀胱:-

腎臓:8.22

下垂体:8.33

甲状腺:8.43

副腎:8.15

膵臓:8.51

乳腺:8.98

唾液腺:8.80

CAGE

子宮:3.44

胎盤:3.66

前立腺:3.30

卵巣:3.53

精巣:3.81

心臓:3.53

骨格筋:3.89

食道:3.91

胃:-

腸:3.45

結腸:3.83

肝臓:3.56

肺:3.61

膀胱:3.36

腎臓:3.36

下垂体:3.15

甲状腺:3.45

副腎:-

膵臓:3.54

乳腺:3.27

唾液腺:3.50

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.13

卵巣:4.47

精巣:4.81

心臓:1.30

骨格筋:0.78

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.40

肝臓:1.85

肺:3.48

膀胱:-

腎臓:2.89

下垂体:-

甲状腺:5.16

副腎:5.49

膵臓:-

乳腺:4.25

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_198216
Gene ID	6628
Unigene ID	Hs.83753
Probe set ID	213175_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000125835
GTEx ID	ENSG00000125835

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_009225
ラット[1]	NM_134358

染色体

20p13 [2,442,280 - 2,451,499]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001163	Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain
IPR006649	Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain, eukaryotic/archaea-type
IPR017131	Small ribonucleoprotein associated, SmB/SmN

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0008334	histone mRNA metabolic process
GO:0031124	mRNA 3'-end processing
GO:0034660	ncRNA metabolic process
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0016070	RNA metabolic process
GO:0008380	RNA splicing
GO:0000387	spliceosomal snRNP assembly
GO:0006369	termination of RNA polymerase II transcription
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0005829	cytosol
GO:0071204	histone pre-mRNA 3'end processing complex
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0030532	small nuclear ribonucleoprotein complex
GO:0005681	spliceosomal complex
GO:0005689	U12-type spliceosomal complex
GO:0005683	U7 snRNP

Molecular Function

GO:0071208	histone pre-mRNA DCP binding
GO:0005515	protein binding

small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function