small nuclear ribonucleoprotein D1 polypeptide 16kDa

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同義遺伝子名

Sm-D autoantigen, SNRPD, Sm-D1, SMD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, SNRPD1, HsT2456, snRNP core protein D1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:24.90

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:-

松果体:148.30

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:5.90

動脈:30

静脈:66.60

リンパ節:20.20

末梢血:36.40

脾臓:37.80

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:12.80

皮膚:24

GeneChip

大脳:5.65

小脳:5.75

脳幹:5.72

脳梁:5.62

松果体:-

末梢神経:5.35

脊柱:5.82

網膜:-

目:-

動脈:5.14

静脈:5.33

リンパ節:5.25

末梢血:-

脾臓:5.06

胸腺:6.10

骨髄:5.60

脂肪:5.30

骨:-

皮膚:5.48

CAGE

大脳:4.33

小脳:-

脳幹:4.39

脳梁:4.10

松果体:4.40

末梢神経:-

脊柱:4.45

網膜:-

目:-

動脈:3.90

静脈:4.18

リンパ節:4.36

末梢血:-

脾臓:4.52

胸腺:4.73

骨髄:-

脂肪:4.15

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.21

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.62

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.45

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:45.60

胎盤:14.60

前立腺:-

卵巣:-

精巣:30.30

心臓:-

骨格筋:20.10

食道:-

胃:42.50

腸:-

結腸:42.40

肝臓:73.90

肺:29.30

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:17.80

乳腺:83.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.56

胎盤:5.21

前立腺:5.49

卵巣:5.44

精巣:5.58

心臓:5.11

骨格筋:5.78

食道:5.47

胃:5.13

腸:5.43

結腸:5.18

肝臓:5.01

肺:5.12

膀胱:-

腎臓:5.10

下垂体:5.47

甲状腺:5.20

副腎:5.22

膵臓:5.13

乳腺:5.28

唾液腺:4.82

CAGE

子宮:4.16

胎盤:4.21

前立腺:4.05

卵巣:4.40

精巣:4.33

心臓:3.95

骨格筋:4.57

食道:4.33

胃:-

腸:4.17

結腸:3.94

肝臓:4.27

肺:3.92

膀胱:4.05

腎臓:4.32

下垂体:4.68

甲状腺:3.97

副腎:-

膵臓:3.96

乳腺:3.95

唾液腺:4.06

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.54

卵巣:4.63

精巣:4.46

心臓:2.73

骨格筋:2.91

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.87

肝臓:3.38

肺:2.94

膀胱:-

腎臓:3.89

下垂体:-

甲状腺:4.11

副腎:4.55

膵臓:-

乳腺:3.59

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_006938
Gene ID	6632
Unigene ID	Hs.464734
Probe set ID	202691_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000167088
GTEx ID	ENSG00000167088

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_009226
ラット[1]	NM_001106163

染色体

18q11.2 [19,192,260 - 19,210,204]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001163	Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain
IPR006649	Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain, eukaryotic/archaea-type

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0034660	ncRNA metabolic process
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0016070	RNA metabolic process
GO:0008380	RNA splicing
GO:0000387	spliceosomal snRNP assembly
GO:0000245	spliceosome assembly

Cellular Component

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0005829	cytosol
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0030532	small nuclear ribonucleoprotein complex
GO:0005689	U12-type spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding

small nuclear ribonucleoprotein D1 polypeptide 16kDa

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function