small nuclear ribonucleoprotein polypeptide F

同義遺伝子名

PBSCF, SmF, snRNP-F, Sm protein F, Sm-F, Small nuclear ribonucleoprotein F, small nuclear ribonucleoprotein polypeptide F, SNRPF

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:5.90

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:118.60

目:35.30

動脈:60

静脈:-

リンパ節:40.40

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:39.40

脂肪:80.70

骨:12.80

皮膚:4.80

GeneChip

大脳:7.17

小脳:7.58

脳幹:7.18

脳梁:7.40

松果体:-

末梢神経:7.52

脊柱:7.35

網膜:-

目:-

動脈:7.57

静脈:7.92

リンパ節:8.29

末梢血:-

脾臓:7.93

胸腺:9.18

骨髄:8.36

脂肪:7.86

骨:-

皮膚:8.18

CAGE

大脳:3.96

小脳:-

脳幹:3.66

脳梁:3.37

松果体:4.13

末梢神経:-

脊柱:3.98

網膜:-

目:-

動脈:4.26

静脈:4.47

リンパ節:4.45

末梢血:-

脾臓:4.16

胸腺:4.59

骨髄:-

脂肪:3.73

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.07

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.18

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.66

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:18.20

胎盤:40.10

前立腺:56.30

卵巣:-

精巣:26

心臓:51.10

骨格筋:60.30

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:8.50

肝臓:105.60

肺:29.30

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:695.90

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:17.80

乳腺:9.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.36

胎盤:7.71

前立腺:7.82

卵巣:8.35

精巣:8.10

心臓:7.67

骨格筋:7.23

食道:8.60

胃:7.83

腸:7.92

結腸:8.23

肝臓:7.70

肺:7.70

膀胱:-

腎臓:7.53

下垂体:7.92

甲状腺:7.96

副腎:7.76

膵臓:7.65

乳腺:8.17

唾液腺:7.72

CAGE

子宮:3.97

胎盤:3.89

前立腺:3.90

卵巣:4.20

精巣:4.09

心臓:4.15

骨格筋:4.26

食道:4.35

胃:-

腸:3.86

結腸:4.18

肝臓:4.37

肺:4.13

膀胱:3.96

腎臓:4.12

下垂体:4.24

甲状腺:4.00

副腎:-

膵臓:4.30

乳腺:4.22

唾液腺:3.84

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.12

卵巣:5.24

精巣:5.01

心臓:2.54

骨格筋:2.29

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.78

肝臓:4.31

肺:3.96

膀胱:-

腎臓:4.38

下垂体:-

甲状腺:4.97

副腎:5.46

膵臓:-

乳腺:4.45

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003095
Gene ID	6636
Unigene ID	Hs.105465
Probe set ID	203832_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000139343
GTEx ID	ENSG00000139343

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_027246
ラット[1]	NM_001126091

染色体

12q23.1 [96,252,706 - 96,297,606]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001163	Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain
IPR006649	Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain, eukaryotic/archaea-type
IPR016487	Small nuclear ribonucleoprotein SmF

GO:0010467	gene expression
GO:0008334	histone mRNA metabolic process
GO:0031124	mRNA 3'-end processing
GO:0034660	ncRNA metabolic process
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0016070	RNA metabolic process
GO:0008380	RNA splicing
GO:0000387	spliceosomal snRNP assembly
GO:0006369	termination of RNA polymerase II transcription
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0005829	cytosol
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0030532	small nuclear ribonucleoprotein complex
GO:0005681	spliceosomal complex
GO:0005689	U12-type spliceosomal complex
GO:0005683	U7 snRNP

small nuclear ribonucleoprotein polypeptide F

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function