SRY (sex determining region Y)-box 2

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同義遺伝子名

MGC2413, SRY (sex determining region Y)-box 2, Transcription factor SOX-2, ANOP3, SOX2, MCOPS3

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:248.90

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:874.80

松果体:-

末梢神経:122.70

脊柱:-

網膜:118.60

目:152.80

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:12.90

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:9.60

GeneChip

大脳:8.39

小脳:6.96

脳幹:8.18

脳梁:9.37

松果体:-

末梢神経:7.86

脊柱:8.96

網膜:-

目:-

動脈:5.46

静脈:5.49

リンパ節:5.88

末梢血:-

脾臓:5.02

胸腺:5.17

骨髄:5.10

脂肪:5.33

骨:-

皮膚:5.83

CAGE

大脳:4.57

小脳:-

脳幹:4.23

脳梁:4.90

松果体:3.12

末梢神経:-

脊柱:4.83

網膜:-

目:-

動脈:3.03

静脈:0.34

リンパ節:1.63

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0.46

骨髄:-

脂肪:0.63

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.49

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.03

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.28

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:3.60

前立腺:11.30

卵巣:-

精巣:13

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:8.50

肝臓:-

肺:39.10

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.37

胎盤:5.08

前立腺:5.76

卵巣:5.65

精巣:5.48

心臓:5.54

骨格筋:5.25

食道:8.21

胃:6.02

腸:5.51

結腸:5.43

肝臓:5.14

肺:5.42

膀胱:-

腎臓:5.13

下垂体:6.92

甲状腺:5.21

副腎:5.37

膵臓:6.04

乳腺:5.27

唾液腺:5.48

CAGE

子宮:1.05

胎盤:0

前立腺:1.64

卵巣:1.03

精巣:1.69

心臓:0.32

骨格筋:0

食道:3.57

胃:-

腸:1.10

結腸:0.80

肝臓:0

肺:1.81

膀胱:0.95

腎臓:0.27

下垂体:3.34

甲状腺:0.12

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:2.17

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.74

卵巣:0.84

精巣:0.59

心臓:0.13

骨格筋:0.02

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.61

肝臓:0.03

肺:2.17

膀胱:-

腎臓:0.05

下垂体:-

甲状腺:0.13

副腎:0.43

膵臓:-

乳腺:0.01

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003106
Gene ID	6657
Unigene ID	Hs.518438
Probe set ID	213721_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000181449
GTEx ID	ENSG00000181449

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_011443
ラット [0]

染色体

3q26.33 [181,429,714 - 181,432,221]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910	High mobility group, HMG1/HMG2
IPR009071	High mobility group, superfamily

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0021984	adenohypophysis development
GO:0060441	branching involved in lung morphogenesis
GO:0007050	cell cycle arrest
GO:0021987	cerebral cortex development
GO:0006325	chromatin organization
GO:0050973	detection of mechanical stimulus involved in equilibrioception
GO:0050910	detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of sound
GO:0048852	diencephalon morphogenesis
GO:0001714	endodermal cell fate specification
GO:0001654	eye development
GO:0030900	forebrain development
GO:0021879	forebrain neuron differentiation
GO:0021781	glial cell fate commitment
GO:0048839	inner ear development
GO:0042472	inner ear morphogenesis
GO:0060235	lens induction in camera-type eye
GO:0048286	lung alveolus development
GO:0030539	male genitalia development
GO:0050680	negative regulation of epithelial cell proliferation
GO:0045665	negative regulation of neuron differentiation
GO:0045668	negative regulation of osteoblast differentiation
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0090090	negative regulation of Wnt receptor signaling pathway through beta-catenin
GO:0048663	neuron fate commitment
GO:0030910	olfactory placode formation
GO:0001649	osteoblast differentiation
GO:0046148	pigment biosynthetic process
GO:0021983	pituitary gland development
GO:0030858	positive regulation of epithelial cell differentiation
GO:0043410	positive regulation of MAPKKK cascade
GO:0002052	positive regulation of neuroblast proliferation
GO:0045666	positive regulation of neuron differentiation
GO:0045747	positive regulation of Notch signaling pathway
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0043281	regulation of caspase activity
GO:0010468	regulation of gene expression
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0070848	response to growth factor stimulus
GO:0032526	response to retinoic acid
GO:0009611	response to wounding
GO:0060042	retina morphogenesis in camera-type eye
GO:0035019	somatic stem cell maintenance
GO:0043586	tongue development

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0005634	nucleus
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0035198	miRNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003700	transcription factor activity

SRY (sex determining region Y)-box 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function