SRY (sex determining region Y)-box 5

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同義遺伝子名

SOX5, Transcription factor SOX-5, SRY (sex determining region Y)-box 5, MGC35153, L-SOX5

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:4.63

小脳:3.86

脳幹:4.71

脳梁:4.54

松果体:-

末梢神経:4.66

脊柱:4.66

網膜:-

目:-

動脈:4.53

静脈:4.48

リンパ節:3.93

末梢血:-

脾臓:4.06

胸腺:3.87

骨髄:4.14

脂肪:4.62

骨:-

皮膚:4.14

CAGE

大脳:2.76

小脳:-

脳幹:3.10

脳梁:2.67

松果体:3.73

末梢神経:-

脊柱:2.86

網膜:-

目:-

動脈:2.83

静脈:2.03

リンパ節:1.46

末梢血:-

脾臓:1.48

胸腺:0.37

骨髄:-

脂肪:3.18

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.13

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.64

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.19

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:4.71

胎盤:3.75

前立腺:3.96

卵巣:4.27

精巣:7.42

心臓:4.12

骨格筋:4

食道:3.83

胃:4.27

腸:3.96

結腸:4.29

肝臓:4.93

肺:4.20

膀胱:-

腎臓:4.02

下垂体:4.43

甲状腺:4.13

副腎:3.94

膵臓:3.79

乳腺:4.25

唾液腺:4.32

CAGE

子宮:3.03

胎盤:1.71

前立腺:2.38

卵巣:2.75

精巣:3.38

心臓:1.81

骨格筋:1.10

食道:1.34

胃:-

腸:1.55

結腸:1.87

肝臓:2.33

肺:2.27

膀胱:2.22

腎臓:1.64

下垂体:3.15

甲状腺:2.24

副腎:-

膵臓:0.58

乳腺:2.64

唾液腺:2.72

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.70

卵巣:0.00

精巣:1.26

心臓:0.07

骨格筋:0.31

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.00

肝臓:0.00

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.11

下垂体:-

甲状腺:0.12

副腎:0.16

膵臓:-

乳腺:0.10

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_006940
Gene ID	6660
Unigene ID	-
Probe set ID	207336_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000134532
GTEx ID	ENSG00000134532

オーソログ対応遺伝子

マウス[5]	NM_001113559, NM_011444
ラット[5]	NM_001113559, NM_011444

染色体

12p12.1 [23,682,440 - 24,103,966]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910	High mobility group, HMG1/HMG2
IPR009071	High mobility group, superfamily

GO:0051216	cartilage development
GO:0045165	cell fate commitment
GO:0021953	central nervous system neuron differentiation
GO:0001701	in utero embryonic development
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0048709	oligodendrocyte differentiation
GO:0032332	positive regulation of chondrocyte differentiation
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0060164	regulation of timing of neuron differentiation
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter

GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0005515	protein binding
GO:0046982	protein heterodimerization activity
GO:0003700	transcription factor activity

SRY (sex determining region Y)-box 5

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function