SP100 nuclear antigen

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同義遺伝子名

FLJ00340, SP100, Nuclear dot-associated Sp100 protein, Nuclear autoantigen Sp-100, DKFZp686E07254, SP100 nuclear antigen, Lysp100b, nuclear antigen Sp100, Speckled 100 kDa

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:20.10 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:112.30 網膜:- 目:70.50 動脈:209.80 静脈:- リンパ節:202.20 末梢血:54.70 脾臓:151.30 胸腺:167.50 骨髄:137.80 脂肪:161.30 骨:25.60 皮膚:105.60
GeneChip 大脳:4.02 小脳:3.82 脳幹:4.16 脳梁:4.01 松果体:- 末梢神経:4.61 脊柱:3.98 網膜:- 目:- 動脈:4.93 静脈:5.05 リンパ節:5.66 末梢血:- 脾臓:6.29 胸腺:5.49 骨髄:5.70 脂肪:4.88 骨:- 皮膚:4.49
CAGE 大脳:2.38 小脳:- 脳幹:3.04 脳梁:2.48 松果体:2.70 末梢神経:- 脊柱:3.54 網膜:- 目:- 動脈:4.08 静脈:4.40 リンパ節:4.44 末梢血:- 脾臓:4.65 胸腺:3.77 骨髄:- 脂肪:4.40 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.26 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.96 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.05 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:118.50 胎盤:102 前立腺:146.40 卵巣:149.10 精巣:26 心臓:25.50 骨格筋:- 食道:- 胃:297.40 腸:129.60 結腸:110.20     肝臓:73.90        肺:102.60    膀胱:1004.90 腎臓:124.80 下垂体:116 甲状腺:163.70 副腎:50.80 膵臓:53.30 乳腺:158 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.78 胎盤:4.88 前立腺:4.61 卵巣:4.92 精巣:3.69 心臓:5.16 骨格筋:4.28 食道:4.38 胃:5.03 腸:4.80 結腸:4.35 肝臓:4.89 肺:5.83 膀胱:- 腎臓:4.56 下垂体:4.26 甲状腺:4.65 副腎:5.14 膵臓:4.75 乳腺:4.71 唾液腺:4.50
CAGE 子宮:3.85 胎盤:3.84 前立腺:3.93 卵巣:3.89 精巣:2.81 心臓:4.29 骨格筋:3.10 食道:3.83 胃:- 腸:4.24 結腸:3.68     肝臓:3.75    肺:4.48 膀胱:4.01 腎臓:3.49 下垂体:3.17 甲状腺:4.08 副腎:- 膵臓:3.34 乳腺:4.28 唾液腺:3.80
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.52 卵巣:1.87 精巣:1.49 心臓:1.44 骨格筋:0.84 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.86     肝臓:0.27        肺:1.32    膀胱:- 腎臓:1.11 下垂体:- 甲状腺:1.28 副腎:1.29 膵臓:- 乳腺:1.31 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003113
Gene ID 6672
Unigene ID Hs.369056
Probe set ID 210218_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000067066
GTEx ID ENSG00000067066

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]  
ラット [0]  

染色体

2q37.1  [231,280,657  -  231,408,805]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910  High mobility group, HMG1/HMG2
IPR000135  High mobility group, HMG1/HMG2, subgroup
IPR009071  High mobility group, superfamily
IPR000770  SAND
IPR010919  SAND-like
IPR019787  Zinc finger, PHD-finger
IPR001965  Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

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17245429
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19279115
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24623443
24654937

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0019221  cytokine-mediated signaling pathway
GO:0006978  DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator
GO:0060333  interferon-gamma-mediated signaling pathway
GO:0051271  negative regulation of cellular component movement
GO:0043392  negative regulation of DNA binding
GO:0010596  negative regulation of endothelial cell migration
GO:0046826  negative regulation of protein export from nucleus
GO:0043433  negative regulation of transcription factor activity
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0032897  negative regulation of viral transcription
GO:0051091  positive regulation of transcription factor activity
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0045765  regulation of angiogenesis
GO:0034097  response to cytokine stimulus
GO:0034341  response to interferon-gamma
GO:0032526  response to retinoic acid
GO:0034340  response to type I interferon
GO:0048384  retinoic acid receptor signaling pathway
GO:0000723  telomere maintenance
GO:0006351  transcription, DNA-dependent
GO:0060337  type I interferon-mediated signaling pathway
GO:0019048  virus-host interaction

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0030870  Mre11 complex
GO:0034399  nuclear periphery
GO:0005730  nucleolus
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus
GO:0016605  PML body

Molecular Function

GO:0070087  chromo shadow domain binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0042802  identical protein binding
GO:0019900  kinase binding
GO:0005515  protein binding
GO:0019904  protein domain specific binding
GO:0042803  protein homodimerization activity
GO:0003713  transcription coactivator activity
GO:0003714  transcription corepressor activity
GO:0008134  transcription factor binding