tripartite motif-containing 21

同義遺伝子名

RNF81, 52 kDa ribonucleoprotein autoantigen Ro/SS-A, 52 kDa Ro protein, RING finger protein 81, TRIM21, SS-A, Sjoegren syndrome type A antigen, Tripartite motif-containing protein 21, RO52, SSA1, Ro(SS-A), SSA, tripartite motif-containing 21

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:1.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:17.60

動脈:-

静脈:-

リンパ節:10.10

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:12.90

骨髄:39.40

脂肪:-

骨:38.40

皮膚:14.40

GeneChip

大脳:6.12

小脳:6.16

脳幹:6.06

脳梁:6.29

松果体:-

末梢神経:6.80

脊柱:6.35

網膜:-

目:-

動脈:6.90

静脈:6.77

リンパ節:7.15

末梢血:-

脾臓:7.73

胸腺:6.84

骨髄:7.05

脂肪:6.90

骨:-

皮膚:6.61

CAGE

大脳:1.40

小脳:-

脳幹:1.68

脳梁:1.80

松果体:1.29

末梢神経:-

脊柱:1.45

網膜:-

目:-

動脈:2.15

静脈:2.31

リンパ節:2.73

末梢血:-

脾臓:2.68

胸腺:2.73

骨髄:-

脂肪:2.80

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.22

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.37

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.20

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:32.80

前立腺:-

卵巣:37.30

精巣:-

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:42.50

腸:-

結腸:25.40

肝臓:31.70

肺:39.10

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:44.50

乳腺:9.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.84

胎盤:6.73

前立腺:6.69

卵巣:6.82

精巣:6.05

心臓:6.67

骨格筋:6.29

食道:6.75

胃:7.10

腸:6.56

結腸:6.93

肝臓:6.79

肺:7.11

膀胱:-

腎臓:6.68

下垂体:6.55

甲状腺:6.86

副腎:6.64

膵臓:6.68

乳腺:6.81

唾液腺:6.61

CAGE

子宮:2.52

胎盤:2.79

前立腺:2.82

卵巣:2.71

精巣:1.79

心臓:1.97

骨格筋:0.74

食道:2.55

胃:-

腸:2.89

結腸:2.34

肝臓:2.43

肺:2.50

膀胱:2.29

腎臓:2.41

下垂体:2.13

甲状腺:2.74

副腎:-

膵臓:2.18

乳腺:1.92

唾液腺:1.82

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.22

卵巣:3.40

精巣:2.31

心臓:1.96

骨格筋:1.38

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.21

肝臓:2.63

肺:3.14

膀胱:-

腎臓:3.08

下垂体:-

甲状腺:2.65

副腎:3.38

膵臓:-

乳腺:2.79

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003141
Gene ID	6737
Unigene ID	Hs.532357
Probe set ID	204804_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000132109
GTEx ID	ENSG00000132109

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_001082552, NM_009277
ラット[1]	NM_001082572, NM_009277

染色体

11p15.4 [4,406,127 - 4,414,926]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001870	B302 (SPRY)-like
IPR003879	Butyrophylin-like
IPR003877	SPla/RYanodine receptor SPRY
IPR018355	SPla/RYanodine receptor subgroup
IPR003613	U box domain
IPR000315	Zinc finger, B-box
IPR020457	Zinc finger, B-box, chordata
IPR013083	Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007049	cell cycle
GO:0045087	innate immune response
GO:0032088	negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity
GO:0090086	negative regulation of protein deubiquitination
GO:0045787	positive regulation of cell cycle
GO:0032481	positive regulation of type I interferon production
GO:0051865	protein autoubiquitination
GO:0031648	protein destabilization
GO:0006513	protein monoubiquitination
GO:0000209	protein polyubiquitination
GO:0070206	protein trimerization
GO:0016567	protein ubiquitination
GO:0032479	regulation of type I interferon production

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0000932	cytoplasmic mRNA processing body
GO:0005829	cytosol
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0030529	ribonucleoprotein complex
GO:0019005	SCF ubiquitin ligase complex

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding
GO:0004842	ubiquitin-protein ligase activity
GO:0008270	zinc ion binding

tripartite motif-containing 21

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function