suppressor of variegation 3-9 homolog 1 (Drosophila)

同義遺伝子名

Su(var)3-9 homolog 1, H3-K9-HMTase 1, SUV39H1, Suppressor of variegation 3-9 homolog 1, SUV39H, MG44, Histone H3-K9 methyltransferase 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:20.10

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:118.60

目:23.50

動脈:-

静脈:66.60

リンパ節:20.20

末梢血:72.90

脾臓:37.80

胸腺:103.10

骨髄:-

脂肪:-

骨:51.20

皮膚:19.20

GeneChip

大脳:5.41

小脳:5.17

脳幹:5.51

脳梁:5.19

松果体:-

末梢神経:5.29

脊柱:5.47

網膜:-

目:-

動脈:5.44

静脈:5.35

リンパ節:5.53

末梢血:-

脾臓:5.30

胸腺:5.57

骨髄:5.84

脂肪:5.49

骨:-

皮膚:5.65

CAGE

大脳:1.42

小脳:-

脳幹:1.71

脳梁:1.89

松果体:0.26

末梢神経:-

脊柱:1.36

網膜:-

目:-

動脈:1.16

静脈:1.57

リンパ節:1.89

末梢血:-

脾臓:1.85

胸腺:2.39

骨髄:-

脂肪:1.12

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.72

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.51

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.58

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:36.50

胎盤:25.50

前立腺:11.30

卵巣:37.30

精巣:17.30

心臓:25.50

骨格筋:-

食道:-

胃:21.20

腸:64.80

結腸:17

肝臓:-

肺:4.90

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.18

胎盤:5.23

前立腺:5.31

卵巣:5.31

精巣:5.64

心臓:5.11

骨格筋:5.31

食道:5.44

胃:5.20

腸:5.54

結腸:5.58

肝臓:5.53

肺:5.18

膀胱:-

腎臓:5.29

下垂体:5.66

甲状腺:5.42

副腎:5.15

膵臓:5.55

乳腺:5.55

唾液腺:5.24

CAGE

子宮:1.58

胎盤:1.77

前立腺:1.00

卵巣:1.27

精巣:1.56

心臓:0.75

骨格筋:1.24

食道:1.48

胃:-

腸:1.27

結腸:0.96

肝臓:1.51

肺:1.08

膀胱:1.02

腎臓:1.32

下垂体:1.13

甲状腺:1.05

副腎:-

膵臓:0.58

乳腺:1.16

唾液腺:1.67

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.15

卵巣:1.51

精巣:1.69

心臓:0.96

骨格筋:1.33

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.80

肝臓:1.22

肺:0.81

膀胱:-

腎臓:1.18

下垂体:-

甲状腺:1.59

副腎:1.92

膵臓:-

乳腺:1.70

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003173
Gene ID	6839
Unigene ID	Hs.522639
Probe set ID	218619_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000101945
GTEx ID	ENSG00000101945

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_011514
ラット[1]	NM_001106956

染色体

Xp11.23 [48,553,945 - 48,567,403]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000953	Chromo domain
IPR007728	Pre-SET domain
IPR003606	Pre-SET zinc-binding sub-group

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007049	cell cycle
GO:0030154	cell differentiation
GO:0006325	chromatin organization
GO:0000183	chromatin silencing at rDNA
GO:0006364	rRNA processing
GO:0006351	transcription, DNA-dependent
GO:0019048	virus-host interaction

Cellular Component

GO:0005677	chromatin silencing complex
GO:0000775	chromosome, centromeric region
GO:0000794	condensed nuclear chromosome
GO:0000792	heterochromatin
GO:0005634	nucleus
GO:0033553	rDNA heterochromatin

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0042054	histone methyltransferase activity
GO:0046974	histone methyltransferase activity (H3-K9 specific)
GO:0018024	histone-lysine N-methyltransferase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0047485	protein N-terminus binding
GO:0008757	S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity
GO:0008270	zinc ion binding

suppressor of variegation 3-9 homolog 1 (Drosophila)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function