TAF1 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 250kDa

同義遺伝子名

TAFII-250, TBP-associated factor 250 kDa, TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, CCG1, P250, BA2R, Cell cycle gene 1 protein, TAF(II)250, p250, TAFII250, CCGS, NSCL2, TAF2A

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:5.72

小脳:5.43

脳幹:5.84

脳梁:5.64

松果体:-

末梢神経:5.57

脊柱:5.48

網膜:-

目:-

動脈:5.63

静脈:5.94

リンパ節:5.73

末梢血:-

脾臓:5.98

胸腺:5.71

骨髄:5.48

脂肪:5.52

骨:-

皮膚:5.48

CAGE

大脳:3.44

小脳:-

脳幹:3.63

脳梁:3.89

松果体:3.91

末梢神経:-

脊柱:3.66

網膜:-

目:-

動脈:3.65

静脈:3.64

リンパ節:3.38

末梢血:-

脾臓:3.47

胸腺:3.50

骨髄:-

脂肪:3.75

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.98

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.74

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.72

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:5.89

胎盤:5.34

前立腺:5.60

卵巣:6.01

精巣:5.44

心臓:5.87

骨格筋:5.62

食道:5.72

胃:5.63

腸:5.68

結腸:5.59

肝臓:5.70

肺:5.55

膀胱:-

腎臓:5.63

下垂体:5.79

甲状腺:5.74

副腎:5.85

膵臓:5.93

乳腺:5.70

唾液腺:5.45

CAGE

子宮:3.90

胎盤:3.08

前立腺:3.59

卵巣:3.54

精巣:3.34

心臓:3.20

骨格筋:3.45

食道:3.27

胃:-

腸:3.23

結腸:3.12

肝臓:2.20

肺:3.30

膀胱:3.60

腎臓:3.00

下垂体:3.45

甲状腺:3.11

副腎:-

膵臓:3.26

乳腺:2.91

唾液腺:3.21

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.38

卵巣:0.76

精巣:1.94

心臓:0.19

骨格筋:0.59

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.33

肝臓:0.57

肺:2.03

膀胱:-

腎臓:0.56

下垂体:-

甲状腺:1.37

副腎:2.14

膵臓:-

乳腺:1.42

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_138923
Gene ID	6872
Unigene ID	-
Probe set ID	216711_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000147133
GTEx ID	ENSG00000147133

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_001081008
ラット [0]

染色体

Xq13.1 [70,586,114 - 70,752,224]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0000080	G1 phase of mitotic cell cycle
GO:0010467	gene expression
GO:0016573	histone acetylation
GO:0018105	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0018107	peptidyl-threonine phosphorylation
GO:0032436	positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0060261	positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0046777	protein amino acid autophosphorylation
GO:0000117	regulation of transcription involved in G2/M-phase of mitotic cell cycle
GO:0006974	response to DNA damage stimulus
GO:0006368	RNA elongation from RNA polymerase II promoter
GO:0051123	RNA polymerase II transcriptional preinitiation complex assembly
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006352	transcription initiation
GO:0006367	transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0016032	viral reproduction
GO:0019048	virus-host interaction

Cellular Component

GO:0071339	MLL1 complex
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005669	transcription factor TFIID complex

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0070577	histone acetyl-lysine binding
GO:0004402	histone acetyltransferase activity
GO:0002039	p53 binding
GO:0005515	protein binding
GO:0004674	protein serine/threonine kinase activity
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0017025	TATA-binding protein binding
GO:0003713	transcription coactivator activity
GO:0008134	transcription factor binding

TAF1 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 250kDa

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function