transporter 2, ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP)

同義遺伝子名

Y1, Peptide transporter TAP2, ATP-binding cassette sub-family B member 3, Peptide transporter PSF2, TAP2, RING11, Peptide supply factor 2, PSF-2, Antigen peptide transporter 2, ABC18, APT2, PSF2, ABCB3, D6S217E

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:15.40

小脳:-

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:112.30

網膜:-

目:5.90

動脈:119.90

静脈:-

リンパ節:151.70

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:12.80

皮膚:38.40

GeneChip

大脳:3.68

小脳:3.57

脳幹:3.76

脳梁:3.63

松果体:-

末梢神経:3.49

脊柱:3.60

網膜:-

目:-

動脈:3.69

静脈:3.79

リンパ節:3.56

末梢血:-

脾臓:3.54

胸腺:3.38

骨髄:3.83

脂肪:3.62

骨:-

皮膚:3.75

CAGE

大脳:2.60

小脳:-

脳幹:2.79

脳梁:2.84

松果体:2.72

末梢神経:-

脊柱:2.71

網膜:-

目:-

動脈:2.85

静脈:3.63

リンパ節:3.65

末梢血:-

脾臓:3.91

胸腺:3.80

骨髄:-

脂肪:3.37

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:54.70

胎盤:120.20

前立腺:45.10

卵巣:111.80

精巣:30.30

心臓:25.50

骨格筋:20.10

食道:-

胃:21.20

腸:-

結腸:25.40

肝臓:-

肺:34.20

膀胱:-

腎臓:114.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:65.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:3.52

胎盤:3.61

前立腺:3.38

卵巣:3.49

精巣:3.38

心臓:3.63

骨格筋:3.77

食道:3.60

胃:3.65

腸:3.72

結腸:3.93

肝臓:3.79

肺:3.68

膀胱:-

腎臓:3.68

下垂体:3.58

甲状腺:3.58

副腎:3.59

膵臓:3.64

乳腺:3.54

唾液腺:4.17

CAGE

子宮:3.16

胎盤:2.69

前立腺:2.98

卵巣:3.14

精巣:2.30

心臓:3.01

骨格筋:2.45

食道:3.56

胃:-

腸:4.01

結腸:3.20

肝臓:3.49

肺:3.75

膀胱:2.68

腎臓:3.11

下垂体:2.57

甲状腺:3.38

副腎:-

膵臓:2.18

乳腺:2.59

唾液腺:2.66

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0

卵巣:0

精巣:0

心臓:0

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0

肝臓:0

肺:0

膀胱:-

腎臓:0

下垂体:-

甲状腺:0

副腎:0

膵臓:-

乳腺:0

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_018833
Gene ID	6891
Unigene ID	Hs.502004
Probe set ID	208428_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000204267
GTEx ID	ENSG00000204267

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_011530
ラット [0]

染色体

HSCHR6_MHC_APD [32,765,310 - 32,790,204]

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6p21.32 [32,781,544 - 32,806,599]

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HSCHR6_MHC_COX [32,703,870 - 32,728,923]

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HSCHR6_MHC_QBL [32,718,320 - 32,735,268]

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HSCHR6_MHC_MCF [32,815,048 - 32,840,077]

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HSCHR6_MHC_DBB [32,759,673 - 32,784,578]

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HSCHR6_MHC_MANN [32,943,409 - 32,960,357]

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HSCHR6_MHC_SSTO [32,871,619 - 32,896,512]

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遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0019885	antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I
GO:0002485	antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I via ER pathway, TAP-dependent
GO:0002489	antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class Ib via ER pathway, TAP-dependent
GO:0042590	antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I
GO:0002479	antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent
GO:0002481	antigen processing and presentation of exogenous protein antigen via MHC class Ib, TAP-dependent
GO:0002474	antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I
GO:0046967	cytosol to ER transport
GO:0019060	intracellular transport of viral proteins in host cell
GO:0046968	peptide antigen transport
GO:0015833	peptide transport
GO:0002591	positive regulation of antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I
GO:0001916	positive regulation of T cell mediated cytotoxicity
GO:0055085	transmembrane transport

Cellular Component

GO:0005783	endoplasmic reticulum
GO:0005789	endoplasmic reticulum membrane
GO:0030176	integral to endoplasmic reticulum membrane
GO:0016021	integral to membrane
GO:0005743	mitochondrial inner membrane
GO:0005634	nucleus
GO:0005886	plasma membrane
GO:0042825	TAP complex

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0042288	MHC class I protein binding
GO:0015421	oligopeptide-transporting ATPase activity
GO:0042605	peptide antigen binding
GO:0015433	peptide antigen-transporting ATPase activity
GO:0015197	peptide transporter activity
GO:0005515	protein binding
GO:0046978	TAP1 binding
GO:0046979	TAP2 binding
GO:0046980	tapasin binding
GO:0005215	transporter activity

IPR017940	ABC transporter integral membrane type 1
IPR013305	ABC transporter, ABCB2
IPR013306	ABC transporter, B3
IPR011527	ABC transporter, transmembrane domain, type 1
IPR003439	ABC transporter-like
IPR005293	Antigen peptide transporter 2
IPR003593	ATPase, AAA+ type, core
IPR014745	MHC class II, alpha/beta chain, N-terminal
IPR000353	MHC class II, beta chain, N-terminal
IPR011162	MHC classes I/II-like antigen recognition protein

transporter 2, ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function