transcription elongation factor A (SII), 2

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同義遺伝子名

Transcription elongation factor TFIIS.l, Transcription elongation factor S-II protein 2, Transcription elongation factor A protein 2, transcription elongation factor A (SII), 2, Testis-specific S-II, TCEA2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:7.73 小脳:7.83 脳幹:7.87 脳梁:7.12 松果体:- 末梢神経:7.65 脊柱:7.23 網膜:- 目:- 動脈:6.81 静脈:6.58 リンパ節:5.92 末梢血:- 脾臓:6.38 胸腺:6.18 骨髄:4.99 脂肪:6.18 骨:- 皮膚:5.98
CAGE 大脳:3.93 小脳:- 脳幹:3.91 脳梁:3.70 松果体:3.27 末梢神経:- 脊柱:3.50 網膜:- 目:- 動脈:3.30 静脈:3.04 リンパ節:2.57 末梢血:- 脾臓:2.61 胸腺:2.84 骨髄:- 脂肪:2.41 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:4.17 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.10 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.27 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:6.86 胎盤:5.79 前立腺:6.90 卵巣:7.16 精巣:8.62 心臓:5.84 骨格筋:5.73 食道:5.64 胃:5.74 腸:5.61 結腸:5.80 肝臓:6.81 肺:5.98 膀胱:- 腎臓:6.64 下垂体:7.24 甲状腺:7.18 副腎:6.19 膵臓:5.63 乳腺:6.55 唾液腺:5.77
CAGE 子宮:3.18 胎盤:2.62 前立腺:3.41 卵巣:3.36 精巣:3.88 心臓:3.01 骨格筋:3.04 食道:2.96 胃:- 腸:2.37 結腸:2.73     肝臓:3.22    肺:2.80 膀胱:3.22 腎臓:2.93 下垂体:3.33 甲状腺:3.28 副腎:- 膵臓:2.86 乳腺:2.99 唾液腺:2.80
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.77 卵巣:3.79 精巣:4.78 心臓:1.72 骨格筋:2.64 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.94     肝臓:1.19        肺:2.69    膀胱:- 腎臓:2.46 下垂体:- 甲状腺:2.95 副腎:2.46 膵臓:- 乳腺:2.50 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003195
Gene ID 6919
Unigene ID -
Probe set ID 203919_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000171703
GTEx ID ENSG00000171703

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_009326
ラット [0]  

染色体

20q13.33  [62,681,189  -  62,703,700]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR017923  TFIIS N-terminal
IPR003618  Transcription elongation factor S-II, central domain
IPR017890  Transcription elongation factor S-IIM
IPR016492  Transcription elongation factor, IIS
IPR006289  Transcription elongation factor, TFIIS
IPR014765  Transcription elongation factor, TFIIS/CRSP70, N-terminal
IPR003617  Transcription elongation factor, TFIIS/CRSP70, N-terminal, sub-type
IPR010990  Transcription elongation factor, TFIIS/elongin A/CRSP70, N-terminal

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1559613
8566795
9441762
9765201
11709559
11780052
12034815
12392551
12477932
12761297
12943681
14702039
15489334
15507123
16169070
16189514
16214896
17374514
17643375
18029348
18655026
21832049
21988832
22939629

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0032784  regulation of RNA elongation
GO:0006354  RNA elongation

Cellular Component

GO:0005813  centrosome
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0008023  transcription elongation factor complex

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0005515  protein binding
GO:0008270  zinc ion binding