HNF1 homeobox B

同義遺伝子名

TCF-2, HNF1B, Variant hepatic nuclear factor 1, VHNF1, HNF-1B, HNF-1beta, FJHN, MODY5, HNF1beta, LFB3, Transcription factor 2, HNF2, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, Homeoprotein LFB3, TCF2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:0.01

小脳:-

脳幹:0

脳梁:0

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:0

網膜:-

目:-

動脈:0

静脈:0

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.03

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:1.04

胎盤:0.77

前立腺:1.53

卵巣:1.11

精巣:1.35

心臓:0

骨格筋:0

食道:0.09

胃:-

腸:2.49

結腸:2.66

肝臓:2.57

肺:2.35

膀胱:0.98

腎臓:4.83

下垂体:0

甲状腺:0

副腎:-

膵臓:3.47

乳腺:0

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.02

卵巣:0.22

精巣:0.98

心臓:0

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.86

肝臓:0.56

肺:0.19

膀胱:-

腎臓:3.23

下垂体:-

甲状腺:0.01

副腎:0.03

膵臓:-

乳腺:0

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001165923
Gene ID	6928
Unigene ID	-
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSG00000108753
GTEx ID	ENSG00000108753

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_009330
ラット[2]	NM_009330

染色体

17q12 [36,046,434 - 36,105,237]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356	Homeobox
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0009952	anterior/posterior pattern formation
GO:0048754	branching morphogenesis of a tube
GO:0048557	embryonic digestive tract morphogenesis
GO:0031018	endocrine pancreas development
GO:0001714	endodermal cell fate specification
GO:0050673	epithelial cell proliferation
GO:0048806	genitalia development
GO:0030902	hindbrain development
GO:0001826	inner cell mass cell differentiation
GO:0030073	insulin secretion
GO:0001822	kidney development
GO:0043066	negative regulation of apoptosis
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0060261	positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0048793	pronephros development
GO:0042663	regulation of endodermal cell fate specification
GO:0030111	regulation of Wnt receptor signaling pathway
GO:0009749	response to glucose stimulus
GO:0060677	ureteric bud elongation

Cellular Component

GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0005515	protein binding
GO:0046982	protein heterodimerization activity
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0003705	RNA polymerase II transcription factor activity, enhancer binding
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003700	transcription factor activity

HNF1 homeobox B

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function