thymine-DNA glycosylase

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同義遺伝子名

thymine-DNA glycosylase, TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:45

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:87.50

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:52.90

動脈:60

静脈:-

リンパ節:50.60

末梢血:18.20

脾臓:18.90

胸腺:167.50

骨髄:19.70

脂肪:40.30

骨:25.60

皮膚:24

GeneChip

大脳:5.77

小脳:5.73

脳幹:5.39

脳梁:6.01

松果体:-

末梢神経:6.08

脊柱:5.81

網膜:-

目:-

動脈:6.74

静脈:6.49

リンパ節:7.50

末梢血:-

脾臓:7.88

胸腺:9.06

骨髄:7.51

脂肪:6.58

骨:-

皮膚:7.57

CAGE

大脳:2.55

小脳:-

脳幹:2.43

脳梁:2.56

松果体:2.85

末梢神経:-

脊柱:2.62

網膜:-

目:-

動脈:2.96

静脈:3.09

リンパ節:3.06

末梢血:-

脾臓:3.16

胸腺:3.51

骨髄:-

脂肪:2.59

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.47

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.65

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.83

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:54.70

胎盤:58.30

前立腺:22.50

卵巣:-

精巣:8.70

心臓:38.30

骨格筋:-

食道:-

胃:21.20

腸:-

結腸:25.40

肝臓:10.60

肺:24.40

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:17.80

乳腺:27.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.45

胎盤:8.19

前立腺:7.68

卵巣:7.20

精巣:5.79

心臓:6.37

骨格筋:6.53

食道:7.57

胃:7.06

腸:6.87

結腸:6.21

肝臓:6.67

肺:7.13

膀胱:-

腎臓:6.26

下垂体:7.01

甲状腺:7.15

副腎:7.23

膵臓:5.66

乳腺:7.22

唾液腺:6.38

CAGE

子宮:3.09

胎盤:3.44

前立腺:2.67

卵巣:2.72

精巣:2.24

心臓:2.77

骨格筋:2.48

食道:2.77

胃:-

腸:3.09

結腸:2.78

肝臓:2.88

肺:2.97

膀胱:2.77

腎臓:2.78

下垂体:3.24

甲状腺:2.20

副腎:-

膵臓:2.34

乳腺:2.53

唾液腺:2.35

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.63

卵巣:2.94

精巣:2.49

心臓:2.31

骨格筋:1.26

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.11

肝臓:2.30

肺:2.62

膀胱:-

腎臓:2.91

下垂体:-

甲状腺:2.82

副腎:3.09

膵臓:-

乳腺:2.36

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003211
Gene ID	6996
Unigene ID	Hs.584809
Probe set ID	203743_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000139372
GTEx ID	ENSG00000139372

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]
ラット [0]

染色体

12q23.3 [104,359,582 - 104,382,652]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003310	G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase
IPR005122	Uracil-DNA glycosylase-like

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006284	base-excision repair
GO:0006285	base-excision repair, AP site formation
GO:0016568	chromatin modification
GO:0045008	depyrimidination
GO:0080111	DNA demethylation
GO:0006281	DNA repair
GO:0009790	embryonic development
GO:0006298	mismatch repair
GO:0032091	negative regulation of protein binding
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0040029	regulation of gene expression, epigenetic

Cellular Component

GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0016605	PML body

Molecular Function

GO:0003684	damaged DNA binding
GO:0019104	DNA N-glycosylase activity
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0030983	mismatched DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0005080	protein kinase C binding
GO:0008263	pyrimidine-specific mismatch base pair DNA N-glycosylase activity
GO:0043566	structure-specific DNA binding
GO:0032183	SUMO binding

thymine-DNA glycosylase

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function