opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive 2

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同義遺伝子名

OPN1MW2, opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive 2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:11.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:4.56 小脳:4.67 脳幹:4.57 脳梁:4.54 松果体:- 末梢神経:4.26 脊柱:4.49 網膜:- 目:- 動脈:4.53 静脈:4.69 リンパ節:4.50 末梢血:- 脾臓:4.40 胸腺:4.10 骨髄:4.68 脂肪:4.49 骨:- 皮膚:4.72
CAGE nodata
RNA-seq 大脳:0 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.02 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.42 胎盤:4.47 前立腺:4.35 卵巣:4.44 精巣:4.28 心臓:4.70 骨格筋:4.91 食道:4.66 胃:4.50 腸:4.75 結腸:4.55 肝臓:4.64 肺:4.63 膀胱:- 腎臓:4.44 下垂体:4.47 甲状腺:4.62 副腎:4.55 膵臓:4.94 乳腺:4.57 唾液腺:4.50
CAGE nodata
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.03 卵巣:0.00 精巣:0.00 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0        肺:0    膀胱:- 腎臓:0 下垂体:- 甲状腺:0 副腎:0.11 膵臓:- 乳腺:0.01 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001048181
Gene ID 728458
Unigene ID Hs.571751
Probe set ID 221327_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000166160
GTEx ID ENSG00000166160

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_008106
ラット [0]  

染色体

Xq28  [153,448,107  -  153,461,633]
Xq28  [153,485,225  -  153,498,755]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000276  7TM GPCR, rhodopsin-like
IPR017452  GPCR, rhodopsin-like superfamily
IPR001760  Opsin
IPR000378  Opsin, red/green sensitive

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1302020
2937147
3303660
8857542
10319869
12853434
15772651
18240029
19493002

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007186  G-protein coupled receptor protein signaling pathway
GO:0007603  phototransduction, visible light
GO:0018298  protein-chromophore linkage
GO:0001523  retinoid metabolic process
GO:0007601  visual perception

Cellular Component

GO:0005887  integral to plasma membrane
GO:0042622  photoreceptor outer segment membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0004930  G-protein coupled receptor activity
GO:0009881  photoreceptor activity