valyl-tRNA synthetase

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同義遺伝子名

valyl-tRNA synthetase, ValRS, valyl-tRNA synthetase 2, Valine--tRNA ligase, VARS, G7A, VARS2, Protein G7a, Valyl-tRNA synthetase

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:91.30 小脳:50.40 脳幹:- 脳梁:58.30 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:164.60 動脈:60 静脈:- リンパ節:111.20 末梢血:145.70 脾臓:37.80 胸腺:77.30 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:51.20 皮膚:48
GeneChip 大脳:5.22 小脳:5.07 脳幹:5.19 脳梁:5.15 松果体:- 末梢神経:5.53 脊柱:5.26 網膜:- 目:- 動脈:5.66 静脈:5.10 リンパ節:5.88 末梢血:- 脾臓:5.64 胸腺:5.16 骨髄:5.51 脂肪:5.58 骨:- 皮膚:5.88
CAGE 大脳:3.40 小脳:- 脳幹:3.33 脳梁:3.19 松果体:3.35 末梢神経:- 脊柱:3.47 網膜:- 目:- 動脈:3.30 静脈:3.14 リンパ節:3.86 末梢血:- 脾臓:3.75 胸腺:3.36 骨髄:- 脂肪:3.27 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.73 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.31 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.86 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:27.30 胎盤:47.40 前立腺:67.60 卵巣:37.30 精巣:177.40 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:276.10 腸:- 結腸:118.70     肝臓:63.30        肺:29.30    膀胱:- 腎臓:187.10 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:62.20 乳腺:74.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.36 胎盤:4.90 前立腺:4.96 卵巣:5.21 精巣:7.82 心臓:5 骨格筋:5.46 食道:6.16 胃:5.43 腸:5.48 結腸:5.57 肝臓:5.59 肺:5.31 膀胱:- 腎臓:5.31 下垂体:6.36 甲状腺:5.21 副腎:5.63 膵臓:5.74 乳腺:6.08 唾液腺:5.01
CAGE 子宮:3.05 胎盤:3.23 前立腺:3.07 卵巣:3.41 精巣:4.86 心臓:3.41 骨格筋:4.37 食道:3.50 胃:- 腸:3.14 結腸:3.41     肝臓:4.08    肺:3.46 膀胱:3.16 腎臓:3.41 下垂体:3.43 甲状腺:2.89 副腎:- 膵臓:4.03 乳腺:4.05 唾液腺:3.22
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.11 卵巣:3.79 精巣:4.71 心臓:2.13 骨格筋:5.29 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.82     肝臓:3.57        肺:2.84    膀胱:- 腎臓:3.31 下垂体:- 甲状腺:3.81 副腎:4.28 膵臓:- 乳腺:3.20 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006295
Gene ID 7407
Unigene ID Hs.520026
Probe set ID 201797_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000096171
ENSG00000204394
ENSG00000226589
GTEx ID ENSG00000096171
ENSG00000204394
ENSG00000226589

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_011690
ラット[1]  NM_053292

染色体

HSCHR6_MHC_APD  [31,756,648  -  31,775,083]
HSCHR6_MHC_QBL  [31,749,636  -  31,753,979]
HSCHR6_MHC_COX  [31,732,662  -  31,751,095]
HSCHR6_MHC_SSTO  [31,735,249  -  31,752,710]
6p21.33  [31,745,295  -  31,763,730]
HSCHR6_MHC_MCF  [31,821,595  -  31,840,030]
HSCHR6_MHC_DBB  [31,727,480  -  31,745,915]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1898367
2477242
2556394
3169261
8294461
8428657
8666263
12477932
14574404
14656967
15161933
15489334
15779907
16229838
17353931
18781797
19380743
19615732
19738201
19851445
19913121
20562859
20628086
21078624
21139048
21145461
21319273
21532573
21890473
21906983
21963094
22053931
22268729
22505724
22623428
22797925
22863883
22939629
23000965
23602568
24457600
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0010467  gene expression
GO:0006414  translational elongation
GO:0006418  tRNA aminoacylation for protein translation
GO:0006438  valyl-tRNA aminoacylation

Cellular Component

GO:0005829  cytosol
GO:0005622  intracellular
GO:0005739  mitochondrion

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0004832  valine-tRNA ligase activity