sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3B

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同義遺伝子名

sema5, FLJ34863, Semaphorin V, Sema A(V), SEMA3B, SEMAA, SEMA5, semaV, Sema V, Semaphorin-3B precursor, SemA, LUCA-1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:79.40 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:184 脊柱:449.20 網膜:- 目:76.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:10.10 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:59 脂肪:40.30 骨:25.60 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:7.46 小脳:6.59 脳幹:7.82 脳梁:8.71 松果体:- 末梢神経:8.50 脊柱:8.06 網膜:- 目:- 動脈:7.43 静脈:6.98 リンパ節:6.03 末梢血:- 脾臓:5.45 胸腺:5.34 骨髄:5.24 脂肪:6.44 骨:- 皮膚:6.21
CAGE 大脳:3.57 小脳:- 脳幹:4.35 脳梁:5.02 松果体:2.23 末梢神経:- 脊柱:4.21 網膜:- 目:- 動脈:3.48 静脈:3.10 リンパ節:0.78 末梢血:- 脾臓:0.56 胸腺:0.06 骨髄:- 脂肪:2.20 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.89 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.50 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.82 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:91.10 胎盤:422.60 前立腺:56.30 卵巣:- 精巣:17.30 心臓:25.50 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:64.80 結腸:50.90     肝臓:31.70        肺:29.30    膀胱:125.60 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:355.50 膵臓:35.60 乳腺:27.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.93 胎盤:10.42 前立腺:6.27 卵巣:6.74 精巣:5.84 心臓:6.45 骨格筋:5.62 食道:6.04 胃:7.02 腸:6.79 結腸:6.85 肝臓:5.77 肺:7.51 膀胱:- 腎臓:7.37 下垂体:5.78 甲状腺:6.39 副腎:9.01 膵臓:6.70 乳腺:6.55 唾液腺:5.75
CAGE 子宮:3.80 胎盤:6.96 前立腺:2.84 卵巣:3.31 精巣:1.92 心臓:2.83 骨格筋:1.20 食道:3.29 胃:- 腸:4.41 結腸:3.61     肝臓:1.16    肺:3.83 膀胱:3.08 腎臓:4.02 下垂体:1.31 甲状腺:2.86 副腎:- 膵臓:3.77 乳腺:2.11 唾液腺:1.82
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.79 卵巣:2.47 精巣:0.72 心臓:0.00 骨格筋:0.32 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.37     肝臓:0.17        肺:4.32    膀胱:- 腎臓:3.08 下垂体:- 甲状腺:0.74 副腎:1.17 膵臓:- 乳腺:1.70 唾液腺:-

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IDs

Refseq ID NM_001005914
Gene ID 7869
Unigene ID Hs.82222
Probe set ID 203071_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000012171
GTEx ID ENSG00000012171

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]  
ラット [0]  

染色体

3p21.31  [50,304,990  -  50,314,977]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003659  Plexin/semaphorin/integrin
IPR001627  Semaphorin/CD100 antigen
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7748561
8603390
8633026
10196546
11085536
11717452
11809707
11922394
12477932
12810670
14702039
15273288
15489334
15831529
17452250
18356290
18458115
18757406
18922901
18985860
19367581
19548530
19683737
20088387
20124444
21988832
23292452
23906303
24280143
24402303

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007411  axon guidance
GO:0007267  cell-cell signaling

Cellular Component

GO:0005783  endoplasmic reticulum
GO:0005576  extracellular region
GO:0016020  membrane

Molecular Function

GO:0004872  receptor activity