HLA-B associated transcript 1

同義遺伝子名

UAP56, Spliceosome RNA helicase BAT1, HLA-B associated transcript 1, 56 kDa U2AF65-associated protein, ATP-dependent RNA helicase p47, HLA-B-associated transcript-1, DDX39B, DEAD box protein UAP56, D6S81E

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:215.70

小脳:314.80

脳幹:-

脳梁:116.60

松果体:445

末梢神経:92

脊柱:112.30

網膜:118.60

目:223.30

動脈:30

静脈:-

リンパ節:404.40

末梢血:127.50

脾臓:113.40

胸腺:837.40

骨髄:196.80

脂肪:363

骨:127.90

皮膚:148.80

GeneChip

大脳:9.01

小脳:10.04

脳幹:9.02

脳梁:9.38

松果体:-

末梢神経:9.59

脊柱:9.21

網膜:-

目:-

動脈:9.96

静脈:9.37

リンパ節:10.39

末梢血:-

脾臓:10.42

胸腺:10.48

骨髄:9.83

脂肪:9.96

骨:-

皮膚:9.93

CAGE

大脳:4.87

小脳:-

脳幹:4.86

脳梁:5.32

松果体:5.72

末梢神経:-

脊柱:5.49

網膜:-

目:-

動脈:4.95

静脈:5.19

リンパ節:5.20

末梢血:-

脾臓:5.02

胸腺:5.48

骨髄:-

脂肪:5.18

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.53

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:5.38

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.93

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:492.10

胎盤:207.70

前立腺:202.80

卵巣:335.40

精巣:138.40

心臓:242.70

骨格筋:120.50

食道:342.80

胃:254.90

腸:259.20

結腸:203.50

肝臓:84.40

肺:317.70

膀胱:-

腎臓:72.80

下垂体:695.90

甲状腺:-

副腎:101.60

膵臓:88.90

乳腺:250.90

唾液腺:328.40

GeneChip

子宮:10.24

胎盤:9.46

前立腺:9.97

卵巣:10.27

精巣:9.69

心臓:9.37

骨格筋:9.05

食道:9.69

胃:9.87

腸:9.49

結腸:9.59

肝臓:9.63

肺:9.97

膀胱:-

腎臓:9.42

下垂体:10.32

甲状腺:10.19

副腎:10.20

膵臓:9.21

乳腺:10.39

唾液腺:9.32

CAGE

子宮:5.70

胎盤:5.03

前立腺:5.16

卵巣:5.46

精巣:5.12

心臓:4.90

骨格筋:5.21

食道:5.19

胃:-

腸:4.97

結腸:5.07

肝臓:5.01

肺:4.97

膀胱:5.35

腎臓:5.03

下垂体:5.54

甲状腺:5.20

副腎:-

膵臓:5.19

乳腺:4.93

唾液腺:5.27

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.60

卵巣:4.92

精巣:3.84

心臓:3.65

骨格筋:3.21

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.47

肝臓:2.93

肺:4.91

膀胱:-

腎臓:4.39

下垂体:-

甲状腺:3.80

副腎:3.34

膵臓:-

乳腺:1.83

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_004640
Gene ID	7919
Unigene ID	Hs.254042
Probe set ID	200041_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000198563 ENSG00000235439
GTEx ID	ENSG00000198563 ENSG00000235439

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_019693
ラット [0]

染色体

HSCHR6_MHC_APD [31,509,287 - 31,518,252]

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6p21.33 [31,497,996 - 31,510,225]

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HSCHR6_MHC_QBL [31,488,280 - 31,504,633]

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HSCHR6_MHC_MANN [31,537,515 - 31,553,854]

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HSCHR6_MHC_SSTO [31,487,943 - 31,500,172]

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HSCHR6_MHC_MCF [31,574,350 - 31,590,705]

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HSCHR6_MHC_DBB [31,480,180 - 31,496,536]

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HSCHR6_MHC_COX [31,485,454 - 31,501,810]

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遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

GO:0046784	intronless viral mRNA export from host nucleus
GO:0006406	mRNA export from nucleus
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0010501	RNA secondary structure unwinding
GO:0008380	RNA splicing
GO:0000245	spliceosome assembly

GO:0005737	cytoplasm
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005634	nucleus
GO:0005681	spliceosomal complex
GO:0000346	transcription export complex
GO:0005687	U4 snRNP
GO:0005688	U6 snRNP

GO:0005524	ATP binding
GO:0043008	ATP-dependent protein binding
GO:0004004	ATP-dependent RNA helicase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0008186	RNA-dependent ATPase activity
GO:0030621	U4 snRNA binding
GO:0017070	U6 snRNA binding

HLA-B associated transcript 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function