RD RNA binding protein

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同義遺伝子名

RDBP, NELF-E, RD protein, D6S45, Negative elongation factor E, RD RNA-binding protein, NELFE, RD RNA binding protein

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:26.10 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:87.50 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:- 目:52.90 動脈:- 静脈:133.30 リンパ節:80.90 末梢血:91.10 脾臓:18.90 胸腺:12.90 骨髄:59 脂肪:40.30 骨:12.80 皮膚:19.20
GeneChip 大脳:7.23 小脳:6.60 脳幹:7.46 脳梁:7.52 松果体:- 末梢神経:7.36 脊柱:7.33 網膜:- 目:- 動脈:7.68 静脈:7.44 リンパ節:7.29 末梢血:- 脾臓:7.11 胸腺:7.72 骨髄:7.12 脂肪:7.47 骨:- 皮膚:7.66
CAGE 大脳:3.73 小脳:- 脳幹:3.59 脳梁:3.81 松果体:3.28 末梢神経:- 脊柱:3.99 網膜:- 目:- 動脈:4.04 静脈:3.91 リンパ節:3.73 末梢血:- 脾臓:3.63 胸腺:4.00 骨髄:- 脂肪:3.80 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:45.60 胎盤:65.60 前立腺:22.50 卵巣:74.50 精巣:38.90 心臓:25.50 骨格筋:60.30 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:67.80     肝臓:21.10        肺:19.60    膀胱:- 腎臓:52 下垂体:- 甲状腺:163.70 副腎:101.60 膵臓:44.50 乳腺:83.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.56 胎盤:7.63 前立腺:7.60 卵巣:7.92 精巣:9.55 心臓:7.17 骨格筋:7.27 食道:7.62 胃:7.14 腸:7.31 結腸:7.33 肝臓:6.77 肺:7.40 膀胱:- 腎臓:7.32 下垂体:7.61 甲状腺:7.58 副腎:7.55 膵臓:7.43 乳腺:7.67 唾液腺:7.44
CAGE 子宮:3.70 胎盤:3.93 前立腺:3.60 卵巣:3.76 精巣:4.61 心臓:4.01 骨格筋:4.27 食道:3.84 胃:- 腸:3.64 結腸:3.80     肝臓:3.18    肺:3.80 膀胱:3.56 腎臓:3.78 下垂体:3.63 甲状腺:3.84 副腎:- 膵臓:4.47 乳腺:4.00 唾液腺:4.19
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0 卵巣:0 精巣:0 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0        肺:0    膀胱:- 腎臓:0 下垂体:- 甲状腺:0 副腎:0 膵臓:- 乳腺:0 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_002904
Gene ID 7936
Unigene ID Hs.423935
Probe set ID 209219_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000204356
ENSG00000206268
ENSG00000206357
ENSG00000229363
ENSG00000231044
ENSG00000233801
GTEx ID ENSG00000204356
ENSG00000206268
ENSG00000206357
ENSG00000229363
ENSG00000231044
ENSG00000233801

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]  NM_001045863, NM_001045864, NM_138580
ラット[2]  NM_001165901, NM_212548, NM_138580

染色体

HSCHR6_MHC_QBL  [31,910,261  -  31,917,261]
HSCHR6_MHC_DBB  [31,902,055  -  31,909,055]
HSCHR6_MHC_COX  [31,907,416  -  31,914,421]
HSCHR6_MHC_SSTO  [31,911,716  -  31,918,721]
HSCHR6_MHC_MCF  [31,996,311  -  32,003,316]
6p21.33  [31,919,864  -  31,926,887]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

2119325
2612324
3353717
8373374
9264031
9776767
9799600
10072631
10199401
11112772
11940650
12477932
12612062
12676794
14574404
14656967
14667819
15302935
15342491
15489334
15561718
16169070
16838299
16880520
16898873
16964243
17081983
17353931
17442680
17499042
17643375
18029348
18303858
18562274
19115949
19143814
19245807
19556007
19615732
19851445
20097260
20305087
20471948
21139048
21890473
22412018
22614758
22740393
23577725
23602568
24453987
24636995
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008150  biological_process
GO:0010467  gene expression
GO:0034244  negative regulation of RNA elongation from RNA polymerase II promoter
GO:0050434  positive regulation of viral transcription
GO:0006368  RNA elongation from RNA polymerase II promoter
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0016032  viral reproduction

Cellular Component

GO:0005739  mitochondrion
GO:0032021  NELF complex
GO:0005730  nucleolus
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0000166  nucleotide binding
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding