suppressor of variegation 3-9 homolog 2 (Drosophila)

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

H3-K9-HMTase 2, Suppressor of variegation 3-9 homolog 2, Histone H3-K9 methyltransferase 2, Su(var)3-9 homolog 2, FLJ23414, SUV39H2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:13 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:89.90 静脈:- リンパ節:20.20 末梢血:18.20 脾臓:18.90 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:- 骨:38.40 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:2.65 小脳:2.87 脳幹:2.71 脳梁:2.62 松果体:- 末梢神経:2.60 脊柱:2.62 網膜:- 目:- 動脈:2.58 静脈:2.65 リンパ節:2.69 末梢血:- 脾臓:2.59 胸腺:2.91 骨髄:2.65 脂肪:2.64 骨:- 皮膚:2.64
CAGE 大脳:2.66 小脳:- 脳幹:2.22 脳梁:1.80 松果体:2.62 末梢神経:- 脊柱:2.32 網膜:- 目:- 動脈:1.72 静脈:1.89 リンパ節:2.02 末梢血:- 脾臓:2.25 胸腺:2.97 骨髄:- 脂肪:1.97 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:45.60 胎盤:14.60 前立腺:33.80 卵巣:- 精巣:82.20 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:25.40     肝臓:31.70        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:26.70 乳腺:18.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:2.70 胎盤:2.81 前立腺:2.71 卵巣:2.84 精巣:2.73 心臓:2.64 骨格筋:2.76 食道:2.68 胃:2.59 腸:2.64 結腸:2.67 肝臓:2.63 肺:2.58 膀胱:- 腎臓:2.63 下垂体:2.60 甲状腺:2.64 副腎:2.61 膵臓:2.79 乳腺:2.67 唾液腺:2.61
CAGE 子宮:2.01 胎盤:2.09 前立腺:2.24 卵巣:2.35 精巣:3.42 心臓:1.81 骨格筋:1.76 食道:2.28 胃:- 腸:1.78 結腸:1.05     肝臓:2.07    肺:1.59 膀胱:2.09 腎臓:2.26 下垂体:2.80 甲状腺:2.03 副腎:- 膵臓:1.87 乳腺:1.16 唾液腺:1.49
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.00 精巣:0 心臓:0.00 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.00        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.00 副腎:0.00 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_024670
Gene ID 79723
Unigene ID Hs.554883
Probe set ID 219262_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000152455
GTEx ID ENSG00000152455

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_022724
ラット[1]  NM_001108883

染色体

10p13  [14,920,819  -  14,946,314]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000953  Chromo domain
IPR007728  Pre-SET domain
IPR003606  Pre-SET zinc-binding sub-group

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8125298
10949293
11094092
12477932
14702039
14765126
15107829
15164054
15489334
16169070
16189514
16344560
16774942
17474147
18231586
20084102
20562864
21060834
21402781
21896933
21900206
23455924
23793025
23891737
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030154  cell differentiation
GO:0006333  chromatin assembly or disassembly
GO:0006338  chromatin remodeling
GO:0007140  male meiosis
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0000785  chromatin
GO:0000775  chromosome, centromeric region
GO:0005720  nuclear heterochromatin

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0046974  histone methyltransferase activity (H3-K9 specific)
GO:0005515  protein binding
GO:0008270  zinc ion binding