lin-28 homolog (C. elegans)

同義遺伝子名

FLJ12457, LIN28, lin-28 homolog (C. elegans), LIN-28, CSDD1, Zinc finger CCHC domain-containing protein 1, LIN28A, Lin-28 homolog A, ZCCHC1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:22.50

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:118.60

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:3.63

小脳:3.86

脳幹:3.65

脳梁:3.64

松果体:-

末梢神経:3.61

脊柱:3.59

網膜:-

目:-

動脈:3.59

静脈:3.73

リンパ節:3.44

末梢血:-

脾臓:3.50

胸腺:3.34

骨髄:3.53

脂肪:3.49

骨:-

皮膚:3.45

CAGE

大脳:0

小脳:-

脳幹:0

脳梁:0

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:0

網膜:-

目:-

動脈:0

静脈:0

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.03

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.01

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:4.30

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:3.46

胎盤:3.80

前立腺:3.40

卵巣:3.50

精巣:4.18

心臓:3.64

骨格筋:3.80

食道:3.37

胃:3.49

腸:3.63

結腸:3.59

肝臓:3.49

肺:3.59

膀胱:-

腎臓:3.50

下垂体:3.67

甲状腺:3.41

副腎:3.52

膵臓:3.49

乳腺:3.55

唾液腺:3.52

CAGE

子宮:0

胎盤:0

前立腺:0

卵巣:0

精巣:0.55

心臓:0

骨格筋:0

食道:0

胃:-

腸:0

結腸:0

肝臓:0

肺:0

膀胱:0

腎臓:0

下垂体:0

甲状腺:0

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.01

卵巣:0.02

精巣:0.46

心臓:0.00

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.00

肝臓:0

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.00

下垂体:-

甲状腺:0.00

副腎:0.06

膵臓:-

乳腺:0.02

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_024674
Gene ID	79727
Unigene ID	Hs.86154
Probe set ID	219823_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000131914
GTEx ID	ENSG00000131914

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_145833
ラット[1]	NM_001109269

染色体

1p36.11 [26,737,269 - 26,756,213]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR011129	Cold shock protein
IPR002059	Cold-shock protein, DNA-binding
IPR001878	Zinc finger, CCHC-type

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007281	germ cell development
GO:0010587	miRNA catabolic process
GO:0045686	negative regulation of glial cell differentiation
GO:0045666	positive regulation of neuron differentiation
GO:0045727	positive regulation of translation
GO:0031054	pre-microRNA processing
GO:0060964	regulation of gene silencing by miRNA
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0031123	RNA 3'-end processing
GO:0019827	stem cell maintenance

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0000932	cytoplasmic mRNA processing body
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0010494	stress granule

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0035198	miRNA binding
GO:0003729	mRNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding
GO:0031369	translation initiation factor binding
GO:0008270	zinc ion binding

lin-28 homolog (C. elegans)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function