Nanog homeobox

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同義遺伝子名

NANOG, FLJ40451, FLJ12581, Nanog homeobox

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:4.81

小脳:4.73

脳幹:4.53

脳梁:4.76

松果体:-

末梢神経:4.82

脊柱:4.78

網膜:-

目:-

動脈:4.60

静脈:4.55

リンパ節:4.49

末梢血:-

脾臓:4.72

胸腺:4.26

骨髄:4.62

脂肪:4.68

骨:-

皮膚:4.68

CAGE

大脳:0

小脳:-

脳幹:0

脳梁:0

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:0

網膜:-

目:-

動脈:0

静脈:0

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.09

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.13

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.04

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:5.16

胎盤:4.42

前立腺:5.11

卵巣:4.92

精巣:5.68

心臓:4.59

骨格筋:4.74

食道:4.34

胃:4.64

腸:4.51

結腸:4.48

肝臓:4.87

肺:4.54

膀胱:-

腎臓:4.90

下垂体:5.69

甲状腺:5.36

副腎:4.74

膵臓:4.43

乳腺:5.31

唾液腺:4.63

CAGE

子宮:0

胎盤:0

前立腺:0

卵巣:0

精巣:0

心臓:0

骨格筋:0

食道:0

胃:-

腸:0

結腸:0

肝臓:0

肺:0

膀胱:0

腎臓:0

下垂体:0

甲状腺:0

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.03

卵巣:0.08

精巣:0.34

心臓:0.06

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.06

肝臓:0

肺:0.02

膀胱:-

腎臓:0.05

下垂体:-

甲状腺:0.02

副腎:0.02

膵臓:-

乳腺:0.05

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_024865
Gene ID	79923
Unigene ID	-
Probe set ID	220184_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000111704
GTEx ID	ENSG00000111704

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_001080945, NM_028016
ラット [0]

染色体

12p13.31 [7,940,390 - 7,948,655]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356	Homeobox
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0030154	cell differentiation
GO:0008283	cell proliferation
GO:0009790	embryonic development
GO:0009880	embryonic pattern specification
GO:0001714	endodermal cell fate specification
GO:0008406	gonad development
GO:0001710	mesodermal cell fate commitment
GO:0030514	negative regulation of BMP signaling pathway
GO:0010454	negative regulation of cell fate commitment
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0008284	positive regulation of cell proliferation
GO:0045931	positive regulation of mitotic cell cycle
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045595	regulation of cell differentiation
GO:0010468	regulation of gene expression
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0032526	response to retinoic acid
GO:0035019	somatic stem cell maintenance
GO:0017145	stem cell division
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0003714	transcription corepressor activity
GO:0003700	transcription factor activity

Nanog homeobox

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function