collagen, type XVIII, alpha 1

同義遺伝子名

collagen XVIII, MGC74745, COL18A1, collagen, type XVIII, alpha 1, Collagen alpha-1(XVIII) chain precursor, KNO, ColXVIII, FLJ27325

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:24.90

小脳:-

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:276

脊柱:449.20

網膜:118.60

目:176.30

動脈:-

静脈:-

リンパ節:40.40

末梢血:54.70

脾臓:37.80

胸腺:-

骨髄:59

脂肪:161.30

骨:51.20

皮膚:33.60

GeneChip

大脳:5.77

小脳:5.59

脳幹:6.14

脳梁:6.96

松果体:-

末梢神経:7.37

脊柱:7.27

網膜:-

目:-

動脈:8.60

静脈:7.47

リンパ節:6.93

末梢血:-

脾臓:7.20

胸腺:5.96

骨髄:6.25

脂肪:7.51

骨:-

皮膚:6.75

CAGE

大脳:3.21

小脳:-

脳幹:4.78

脳梁:4.90

松果体:2.41

末梢神経:-

脊柱:5.23

網膜:-

目:-

動脈:5.82

静脈:4.21

リンパ節:3.57

末梢血:-

脾臓:3.97

胸腺:2.34

骨髄:-

脂肪:4.10

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.48

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.98

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.86

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:173.20

胎盤:76.50

前立腺:45.10

卵巣:-

精巣:60.60

心臓:140.50

骨格筋:40.20

食道:-

胃:-

腸:97.20

結腸:50.90

肝臓:52.80

肺:53.80

膀胱:-

腎臓:104

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:26.70

乳腺:65.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.32

胎盤:6.56

前立腺:6.12

卵巣:7.43

精巣:6.22

心臓:6.93

骨格筋:5.66

食道:6.54

胃:6.82

腸:7.29

結腸:6.72

肝臓:9.64

肺:6.93

膀胱:-

腎臓:8.22

下垂体:7.24

甲状腺:7.44

副腎:7.40

膵臓:7.23

乳腺:7.49

唾液腺:5.87

CAGE

子宮:4.84

胎盤:3.90

前立腺:4.29

卵巣:4.90

精巣:3.91

心臓:4.60

骨格筋:3.62

食道:4.11

胃:-

腸:3.55

結腸:4.08

肝臓:7.06

肺:3.95

膀胱:4.99

腎臓:4.68

下垂体:3.50

甲状腺:4.25

副腎:-

膵臓:3.96

乳腺:4.52

唾液腺:3.22

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.41

卵巣:1.43

精巣:2.43

心臓:0.70

骨格筋:0.16

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.51

肝臓:4.96

肺:0.98

膀胱:-

腎臓:1.13

下垂体:-

甲状腺:1.34

副腎:1.60

膵臓:-

乳腺:1.45

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_030582
Gene ID	80781
Unigene ID	Hs.517356
Probe set ID	209081_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000182871
GTEx ID	ENSG00000182871

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_001109991, NM_009929
ラット [0]

染色体

21q22.3 [46,825,052 - 46,933,634]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020067

Frizzled-like domain

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0001525	angiogenesis
GO:0007155	cell adhesion
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0001886	endothelial cell morphogenesis
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0008285	negative regulation of cell proliferation
GO:0009887	organ morphogenesis
GO:0043065	positive regulation of apoptosis
GO:0030335	positive regulation of cell migration
GO:0008284	positive regulation of cell proliferation
GO:0007601	visual perception

Cellular Component

GO:0005604	basement membrane
GO:0005581	collagen
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0031012	extracellular matrix
GO:0005576	extracellular region
GO:0005615	extracellular space

Molecular Function

GO:0042802	identical protein binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0005515	protein binding
GO:0005198	structural molecule activity

collagen, type XVIII, alpha 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function