fragile X mental retardation, autosomal homolog 1

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同義遺伝子名

fragile X mental retardation, autosomal homolog 1, FXR1, hFXR1P

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:93.60

小脳:100.80

脳幹:-

脳梁:349.90

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:112.30

網膜:-

目:105.80

動脈:209.80

静脈:199.90

リンパ節:50.60

末梢血:255.10

脾臓:170.20

胸腺:618.40

骨髄:19.70

脂肪:403.30

骨:191.90

皮膚:177.60

GeneChip

大脳:7.07

小脳:6.04

脳幹:7.50

脳梁:7.83

松果体:-

末梢神経:7.98

脊柱:7.56

網膜:-

目:-

動脈:7.69

静脈:7.61

リンパ節:7.97

末梢血:-

脾臓:7.56

胸腺:8.94

骨髄:7.60

脂肪:7.76

骨:-

皮膚:7.50

CAGE

大脳:4.81

小脳:-

脳幹:5.19

脳梁:4.64

松果体:5.08

末梢神経:-

脊柱:5.49

網膜:-

目:-

動脈:4.41

静脈:4.22

リンパ節:4.18

末梢血:-

脾臓:4.48

胸腺:4.90

骨髄:-

脂肪:4.81

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.71

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.35

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.88

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:255.20

胎盤:87.40

前立腺:123.90

卵巣:149.10

精巣:307.20

心臓:332.10

骨格筋:120.50

食道:-

胃:191.20

腸:194.40

結腸:42.40

肝臓:84.40

肺:141.70

膀胱:125.60

腎臓:145.60

下垂体:116

甲状腺:163.70

副腎:355.50

膵臓:53.30

乳腺:130.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.14

胎盤:7.12

前立腺:8.18

卵巣:8.48

精巣:10.13

心臓:8.02

骨格筋:9.58

食道:7.64

胃:7.24

腸:7.68

結腸:5.97

肝臓:7.19

肺:7.74

膀胱:-

腎臓:6.87

下垂体:7.57

甲状腺:7.76

副腎:8.13

膵臓:7.93

乳腺:7.45

唾液腺:7.31

CAGE

子宮:4.89

胎盤:4.61

前立腺:4.86

卵巣:4.78

精巣:5.29

心臓:4.95

骨格筋:6.51

食道:4.79

胃:-

腸:4.35

結腸:4.11

肝臓:4.22

肺:4.55

膀胱:4.99

腎臓:4.55

下垂体:5.15

甲状腺:4.95

副腎:-

膵臓:4.16

乳腺:4.74

唾液腺:4.28

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.12

卵巣:2.88

精巣:1.72

心臓:0.88

骨格筋:0.52

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.25

肝臓:1.39

肺:2.41

膀胱:-

腎臓:1.90

下垂体:-

甲状腺:3.06

副腎:2.33

膵臓:-

乳腺:2.49

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001013438
Gene ID	8087
Unigene ID	Hs.478407
Probe set ID	201637_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000114416
GTEx ID	ENSG00000114416

オーソログ対応遺伝子

マウス[5]	NM_001113188, NM_001113189, NM_008053
ラット [0]

染色体

3q26.33 [180,585,929 - 180,694,950]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR004087	K Homology
IPR004088	K Homology, type 1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006915	apoptosis
GO:0030154	cell differentiation
GO:0007517	muscle organ development
GO:0017148	negative regulation of translation

Cellular Component

GO:0043034	costamere
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005730	nucleolus
GO:0005844	polysome

Molecular Function

GO:0002151	G-quadruplex RNA binding
GO:0003730	mRNA 3'-UTR binding
GO:0003723	RNA binding

fragile X mental retardation, autosomal homolog 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function