ALX homeobox 1

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同義遺伝子名

CART1, cartilage paired-class homeoprotein 1, Cartilage homeoprotein 1, CART-1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:14.40
GeneChip 大脳:4.79 小脳:4.80 脳幹:4.81 脳梁:4.72 松果体:- 末梢神経:4.56 脊柱:4.58 網膜:- 目:- 動脈:4.68 静脈:4.68 リンパ節:4.50 末梢血:- 脾臓:4.43 胸腺:4.40 骨髄:4.67 脂肪:4.72 骨:- 皮膚:4.73
CAGE 大脳:0.03 小脳:- 脳幹:0.10 脳梁:0 松果体:0 末梢神経:- 脊柱:0 網膜:- 目:- 動脈:0 静脈:0 リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0 骨髄:- 脂肪:0.63 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.02 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:10.60        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.74 胎盤:4.57 前立腺:4.59 卵巣:4.67 精巣:4.72 心臓:4.70 骨格筋:4.69 食道:4.52 胃:4.62 腸:4.65 結腸:4.69 肝臓:4.67 肺:4.60 膀胱:- 腎臓:5.08 下垂体:4.89 甲状腺:4.58 副腎:4.63 膵臓:5.05 乳腺:4.56 唾液腺:4.77
CAGE 子宮:1.24 胎盤:0.08 前立腺:0.53 卵巣:0.95 精巣:0.32 心臓:0.04 骨格筋:0.09 食道:0.09 胃:- 腸:0 結腸:0     肝臓:0    肺:0 膀胱:0.73 腎臓:1.24 下垂体:0.34 甲状腺:0.12 副腎:- 膵臓:0 乳腺:1.16 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.65 卵巣:0.13 精巣:0.58 心臓:0.01 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0        肺:0    膀胱:- 腎臓:1.39 下垂体:- 甲状腺:0.07 副腎:0 膵臓:- 乳腺:0.03 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006982
Gene ID 8092
Unigene ID Hs.41683
Probe set ID 206837_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000180318
GTEx ID ENSG00000180318

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_172553
ラット [0]  

染色体

12q21.31  [85,673,885  -  85,695,562]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356  Homeobox
IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7592751
7690966
8673125
8756334
9753625
9847249
12477932
12929931
15489334
16189514
18029348
18976975
20398657
20451171
20932315
23288509
24081945

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0009952  anterior/posterior pattern formation
GO:0007420  brain development
GO:0001502  cartilage condensation
GO:0030326  embryonic limb morphogenesis
GO:0048704  embryonic skeletal system morphogenesis
GO:0014031  mesenchymal cell development
GO:0007275  multicellular organismal development
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0001843  neural tube closure
GO:0060021  palate development
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0005634  nucleus
GO:0005667  transcription factor complex

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0046982  protein heterodimerization activity
GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003714  transcription corepressor activity
GO:0003700  transcription factor activity