splicing factor 3b, subunit 5, 10kDa

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同義遺伝子名

SF3b5, MGC3133, SF3b10, splicing factor 3b, subunit 5, 10kDa, SF3B10, Splicing factor 3B subunit 5, SF3B5, Pre-mRNA-splicing factor SF3b 10 kDa subunit

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:36.70 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:- 松果体:890.10 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:118.60 目:164.60 動脈:89.90 静脈:- リンパ節:60.70 末梢血:145.70 脾臓:37.80 胸腺:- 骨髄:157.40 脂肪:121 骨:64 皮膚:139.20
GeneChip 大脳:7.79 小脳:7.15 脳幹:8.01 脳梁:7.69 松果体:- 末梢神経:8.24 脊柱:7.89 網膜:- 目:- 動脈:8.31 静脈:8.21 リンパ節:8.50 末梢血:- 脾臓:8.27 胸腺:8.79 骨髄:8.47 脂肪:8.38 骨:- 皮膚:8.84
CAGE 大脳:4.02 小脳:- 脳幹:3.95 脳梁:3.86 松果体:4.07 末梢神経:- 脊柱:3.93 網膜:- 目:- 動脈:4.31 静脈:4.40 リンパ節:4.54 末梢血:- 脾臓:4.20 胸腺:4.51 骨髄:- 脂肪:3.96 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:4.51 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:5.49 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:5.59 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:82 胎盤:65.60 前立腺:78.90 卵巣:37.30 精巣:121.10 心臓:229.90 骨格筋:140.60 食道:- 胃:- 腸:64.80 結腸:33.90     肝臓:105.60        肺:132    膀胱:- 腎臓:104 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:152.40 膵臓:168.90 乳腺:46.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.44 胎盤:7.68 前立腺:8.64 卵巣:8.79 精巣:8.81 心臓:8.25 骨格筋:8.12 食道:8.89 胃:8.35 腸:8.66 結腸:8.81 肝臓:8.36 肺:8.34 膀胱:- 腎臓:8.95 下垂体:8.67 甲状腺:8.56 副腎:8.66 膵臓:8.67 乳腺:8.75 唾液腺:8.52
CAGE 子宮:4.06 胎盤:3.99 前立腺:4.08 卵巣:4.10 精巣:4.53 心臓:4.43 骨格筋:4.36 食道:4.51 胃:- 腸:4.29 結腸:4.64     肝臓:4.89    肺:4.28 膀胱:4.05 腎臓:4.60 下垂体:4.36 甲状腺:4.44 副腎:- 膵臓:5.10 乳腺:4.39 唾液腺:4.35
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:5.82 卵巣:5.51 精巣:5.62 心臓:4.66 骨格筋:5.62 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:5.33     肝臓:5.51        肺:5.69    膀胱:- 腎臓:5.78 下垂体:- 甲状腺:5.70 副腎:5.74 膵臓:- 乳腺:5.41 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_031287
Gene ID 83443
Unigene ID Hs.110695
Probe set ID 221263_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000169976
GTEx ID ENSG00000169976

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_175102
ラット[1]  NM_001126092

染色体

6q24.2  [144,416,018  -  144,416,754]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR009846  Splicing factor 3B subunit 5/RDS3 complex subunit 10
IPR017089  Splicing factor 3B, subunit 5

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11076863
11256614
12226669
12234937
12477932
14574404
15146077
15489334
15489336
16159877
16341674
16381901
17332742
20360068
21139048
21890473
21963094
22053931
22505724
22939629
23602568

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0010467  gene expression
GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380  RNA splicing

Cellular Component

GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus
GO:0005689  U12-type spliceosomal complex