SET domain, bifurcated 2

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同義遺伝子名

DKFZp586I0123, CLLL8, Histone H3-K9 methyltransferase, H3-K9-HMTase, chromosome 13 open reading frame 4, C13orf4, DKFZp761J1217, SETDB2, CLLD8, SET domain, bifurcated 2, SET domain bifurcated 2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:15.40 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:171.90 末梢血:36.40 脾臓:18.90 胸腺:38.70 骨髄:- 脂肪:- 骨:25.60 皮膚:14.40
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.63 小脳:- 脳幹:2.52 脳梁:2.51 松果体:2.67 末梢神経:- 脊柱:2.51 網膜:- 目:- 動脈:2.30 静脈:2.91 リンパ節:3.05 末梢血:- 脾臓:3.14 胸腺:2.97 骨髄:- 脂肪:2.65 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.17 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.30 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.99 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:14.60 前立腺:22.50 卵巣:37.30 精巣:69.20 心臓:51.10 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:52.80        肺:9.80    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:101.60 膵臓:35.60 乳腺:18.60 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.95 胎盤:2.08 前立腺:2.97 卵巣:2.78 精巣:2.94 心臓:2.70 骨格筋:1.44 食道:2.62 胃:- 腸:2.34 結腸:2.46     肝臓:2.39    肺:2.97 膀胱:2.80 腎臓:2.80 下垂体:2.92 甲状腺:2.91 副腎:- 膵臓:2.34 乳腺:2.64 唾液腺:2.66
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.86 卵巣:2.04 精巣:2.44 心臓:1.56 骨格筋:0.97 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.65     肝臓:0.95        肺:1.24    膀胱:- 腎臓:2.03 下垂体:- 甲状腺:2.09 副腎:1.56 膵臓:- 乳腺:1.19 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001160308
Gene ID 83852
Unigene ID Hs.631789
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000136169
GTEx ID ENSG00000136169

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001081024
ラット[1]  NM_001081024

染色体

13q14.2  [50,018,429  -  50,069,138]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR016177  DNA-binding, integrase-type
IPR001739  Methyl-CpG DNA binding
IPR007728  Pre-SET domain
IPR003606  Pre-SET zinc-binding sub-group

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11306461
12477932
12754510
15057823
15489334
16344560
18498648
20085599
20404330
22797925

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051301  cell division
GO:0007059  chromosome segregation
GO:0001947  heart looping
GO:0051567  histone H3-K9 methylation
GO:0070986  left/right axis specification
GO:0007067  mitosis
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005694  chromosome
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0046974  histone methyltransferase activity (H3-K9 specific)
GO:0008270  zinc ion binding