butyrobetaine (gamma), 2-oxoglutarate dioxygenase (gamma-butyrobetaine hydroxylase) 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

Gamma-butyrobetaine dioxygenase, G-BBH, BBOX, BBOX1, Gamma-butyrobetaine hydroxylase, gamma-BBH, Gamma-BBH, BBH, Gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:40.30 小脳:63 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:6.21 小脳:4.60 脳幹:6.66 脳梁:6.73 松果体:- 末梢神経:4.14 脊柱:7.80 網膜:- 目:- 動脈:4.01 静脈:4.19 リンパ節:4.05 末梢血:- 脾臓:3.73 胸腺:3.83 骨髄:4.42 脂肪:4.45 骨:- 皮膚:6.51
CAGE 大脳:2.66 小脳:- 脳幹:2.69 脳梁:2.81 松果体:1.13 末梢神経:- 脊柱:3.48 網膜:- 目:- 動脈:0.18 静脈:0.34 リンパ節:0.40 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0.23 骨髄:- 脂肪:0.14 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.55 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.07 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.01 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:25.50 前立腺:- 卵巣:- 精巣:8.70 心臓:25.50 骨格筋:- 食道:342.80 胃:- 腸:64.80 結腸:-     肝臓:21.10        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:530.30 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.95 胎盤:4.32 前立腺:4.10 卵巣:4.95 精巣:3.82 心臓:4.12 骨格筋:4.24 食道:6.13 胃:4 腸:3.98 結腸:4.11 肝臓:7.01 肺:4.27 膀胱:- 腎臓:10.29 下垂体:4.91 甲状腺:5.91 副腎:3.69 膵臓:4.45 乳腺:6.24 唾液腺:3.96
CAGE 子宮:1.03 胎盤:1.69 前立腺:0.58 卵巣:0.64 精巣:0.10 心臓:0.28 骨格筋:0.13 食道:2.67 胃:- 腸:0 結腸:0.04     肝臓:2.92    肺:0.18 膀胱:0.09 腎臓:5.79 下垂体:3.19 甲状腺:3.29 副腎:- 膵臓:0.94 乳腺:0.55 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.78 卵巣:1.53 精巣:0.55 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.15     肝臓:1.97        肺:0.33    膀胱:- 腎臓:6.36 下垂体:- 甲状腺:4.23 副腎:0 膵臓:- 乳腺:2.89 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003986
Gene ID 8424
Unigene ID Hs.591996
Probe set ID 205363_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000129151
GTEx ID ENSG00000129151

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_130452
ラット[1]  NM_022629

染色体

11p14.2  [27,062,272  -  27,149,356]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR012775  Gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase
IPR003819  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1735445
1962562
3110383
3378057
6497835
7156861
9753662
10526231
12477932
15489334
16169070
16344560
17110165
18029348
19056867
19240061
20379614
20599753
20877624

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0045329  carnitine biosynthetic process
GO:0034641  cellular nitrogen compound metabolic process

Cellular Component

GO:0015629  actin cytoskeleton
GO:0005829  cytosol
GO:0043231  intracellular membrane-bounded organelle
GO:0005739  mitochondrion

Molecular Function

GO:0008336  gamma-butyrobetaine dioxygenase activity
GO:0005506  iron ion binding
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0008270  zinc ion binding