SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5

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同義遺伝子名

SMARCA5, WCRF135, hSNF2H, hISWI, ISWI, Sucrose nonfermenting protein 2 homolog, SNF2H

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:4.70

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:3.86

小脳:3.51

脳幹:4.09

脳梁:4.28

松果体:-

末梢神経:3.98

脊柱:4.16

網膜:-

目:-

動脈:3.90

静脈:3.73

リンパ節:4.07

末梢血:-

脾臓:4.18

胸腺:5.10

骨髄:3.92

脂肪:3.73

骨:-

皮膚:3.70

CAGE

大脳:4.62

小脳:-

脳幹:4.78

脳梁:4.69

松果体:5.09

末梢神経:-

脊柱:4.78

網膜:-

目:-

動脈:4.07

静脈:4.32

リンパ節:4.25

末梢血:-

脾臓:4.67

胸腺:4.94

骨髄:-

脂肪:4.33

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.57

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.78

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.69

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:4.30

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:4.90

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.35

胎盤:4.39

前立腺:4.54

卵巣:4.22

精巣:4.99

心臓:3.71

骨格筋:3.71

食道:3.79

胃:3.78

腸:3.66

結腸:3.24

肝臓:3.50

肺:4.07

膀胱:-

腎臓:3.31

下垂体:4.06

甲状腺:4.23

副腎:4.40

膵臓:3.69

乳腺:3.83

唾液腺:3.38

CAGE

子宮:4.51

胎盤:4.57

前立腺:4.48

卵巣:4.52

精巣:4.98

心臓:4.44

骨格筋:4.22

食道:4.34

胃:-

腸:4.36

結腸:4.20

肝臓:4.22

肺:4.67

膀胱:4.53

腎臓:4.28

下垂体:4.92

甲状腺:4.43

副腎:-

膵臓:3.82

乳腺:4.09

唾液腺:3.83

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.03

卵巣:4.31

精巣:5.13

心臓:3.45

骨格筋:3.53

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.06

肝臓:2.41

肺:3.70

膀胱:-

腎臓:3.76

下垂体:-

甲状腺:4.36

副腎:3.63

膵臓:-

乳腺:3.53

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003601
Gene ID	8467
Unigene ID	Hs.558422
Probe set ID	213859_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000153147
GTEx ID	ENSG00000153147

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_053124
ラット [0]

染色体

4q31.21 [144,434,616 - 144,478,639]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related
IPR001005	SANT, DNA-binding

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006200	ATP catabolic process
GO:0043044	ATP-dependent chromatin remodeling
GO:0034080	CenH3-containing nucleosome assembly at centromere
GO:0006338	chromatin remodeling
GO:0000183	chromatin silencing at rDNA
GO:0006302	double-strand break repair
GO:0009790	embryonic development
GO:0006334	nucleosome assembly
GO:0016584	nucleosome positioning
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006352	transcription initiation

Cellular Component

GO:0005677	chromatin silencing complex
GO:0000793	condensed chromosome
GO:0043596	nuclear replication fork
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0016589	NURF complex
GO:0031213	RSF complex

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0016887	ATPase activity
GO:0003677	DNA binding
GO:0004386	helicase activity
GO:0042393	histone binding
GO:0031491	nucleosome binding
GO:0005515	protein binding

SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function