RNA binding motif protein 17

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同義遺伝子名

Splicing factor 45, SPF45, RNA-binding motif protein 17, MGC14439, RNA binding motif protein 17, RBM17, 45 kDa-splicing factor

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:40.30 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:- 網膜:118.60 目:123.40 動脈:60 静脈:- リンパ節:161.80 末梢血:36.40 脾臓:37.80 胸腺:90.20 骨髄:- 脂肪:- 骨:64 皮膚:72
GeneChip nodata
CAGE 大脳:4.17 小脳:- 脳幹:4.14 脳梁:4.27 松果体:3.64 末梢神経:- 脊柱:4.47 網膜:- 目:- 動脈:4.03 静脈:3.98 リンパ節:4.00 末梢血:- 脾臓:4.32 胸腺:4.29 骨髄:- 脂肪:4.06 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.12 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.12 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:127.60 胎盤:98.40 前立腺:33.80 卵巣:- 精巣:47.60 心臓:63.90 骨格筋:80.40 食道:- 胃:21.20 腸:32.40 結腸:110.20     肝臓:52.80        肺:112.40    膀胱:- 腎臓:166.40 下垂体:- 甲状腺:163.70 副腎:50.80 膵臓:62.20 乳腺:83.60 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:4.06 胎盤:4.02 前立腺:3.89 卵巣:3.99 精巣:4.10 心臓:4.19 骨格筋:4.36 食道:3.90 胃:- 腸:3.97 結腸:4.07     肝臓:3.64    肺:4.09 膀胱:3.97 腎臓:3.87 下垂体:3.79 甲状腺:3.85 副腎:- 膵臓:3.77 乳腺:4.60 唾液腺:3.63
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.10 卵巣:0.15 精巣:0.23 心臓:0.26 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.22     肝臓:0.00        肺:0.38    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.15 副腎:0.49 膵臓:- 乳腺:0.52 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001145547
Gene ID 84991
Unigene ID Hs.498548
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000134453
GTEx ID ENSG00000134453

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_152824
ラット[1]  NM_001013058

染色体

10p15.1  [6,130,949  -  6,159,420]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1
IPR003954  RNA recognition, domain 1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9731529
12015979
12086596
12234937
12477932
14578179
15146197
15489334
16055720
16061639
16189514
16385451
17081983
17207965
17332742
17577209
17589525
17676041
18029348
18337722
18854154
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19454010
19471022
20360068
20410501
21139048
21145461
21319273
21835928
22113938
22190034
22365833
22615491
22990118
23184937
24250222
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006397  mRNA processing
GO:0008380  RNA splicing

Cellular Component

GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0005681  spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0000166  nucleotide binding
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding