protein tyrosine phosphatase, receptor type, f polypeptide (PTPRF), interacting protein (liprin), alpha 1

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同義遺伝子名

MGC26800, LAR-interacting protein 1, PTPRF-interacting protein alpha-1, LIP.1, Liprin-alpha-1, LIPRIN, PPFIA1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:48.60 小脳:88.20 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:112.30 網膜:- 目:88.20 動脈:- 静脈:66.60 リンパ節:111.20 末梢血:36.40 脾臓:37.80 胸腺:103.10 骨髄:39.40 脂肪:121 骨:38.40 皮膚:312
GeneChip 大脳:5.32 小脳:5.84 脳幹:5.36 脳梁:5.67 松果体:- 末梢神経:5.18 脊柱:5.67 網膜:- 目:- 動脈:5.22 静脈:4.61 リンパ節:5.03 末梢血:- 脾臓:5.23 胸腺:6.14 骨髄:5.52 脂肪:5.29 骨:- 皮膚:5.52
CAGE 大脳:3.76 小脳:- 脳幹:3.66 脳梁:4.01 松果体:3.73 末梢神経:- 脊柱:4.22 網膜:- 目:- 動脈:3.65 静脈:3.50 リンパ節:3.35 末梢血:- 脾臓:3.29 胸腺:3.37 骨髄:- 脂肪:3.62 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.71 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.20 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.67 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:109.40 胎盤:91.10 前立腺:33.80 卵巣:- 精巣:155.80 心臓:38.30 骨格筋:- 食道:- 胃:191.20 腸:64.80 結腸:195     肝臓:42.20        肺:48.90    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:185.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.73 胎盤:5.84 前立腺:5.89 卵巣:5.57 精巣:7.69 心臓:5.17 骨格筋:5.45 食道:5.55 胃:5.20 腸:5.33 結腸:5.53 肝臓:4.99 肺:5.13 膀胱:- 腎臓:5.39 下垂体:5.58 甲状腺:5.15 副腎:5.06 膵臓:4.60 乳腺:5.37 唾液腺:5.06
CAGE 子宮:3.44 胎盤:3.82 前立腺:3.38 卵巣:3.33 精巣:4.00 心臓:3.52 骨格筋:3.57 食道:3.24 胃:- 腸:3.55 結腸:3.68     肝臓:3.24    肺:3.75 膀胱:3.42 腎臓:3.57 下垂体:4.12 甲状腺:3.42 副腎:- 膵臓:3.23 乳腺:4.41 唾液腺:2.90
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.25 卵巣:0.43 精巣:2.64 心臓:0.02 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.04     肝臓:0.10        肺:0.16    膀胱:- 腎臓:0.16 下垂体:- 甲状腺:0.52 副腎:0.15 膵臓:- 乳腺:0.21 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_177423
Gene ID 8500
Unigene ID Hs.530749
Probe set ID 210235_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000131626
GTEx ID ENSG00000131626

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001033319, NM_001195086
ラット[1]  NM_001106320, NM_001195086

染色体

11q13.3  [70,116,806  -  70,230,509]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001660  Sterile alpha motif
IPR010993  Sterile alpha motif homology
IPR013761  Sterile alpha motif-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7796809
8524829
9624153
10737800
11931740
12477932
12629171
12923177
14702039
15324660
15489334
16189514
16313174
16713569
16973615
17081983
17363573
17419996
18196592
18782753
19060904
19156129
19690048
19787783
20096687
21139048
21145461
21157931
22072677
22295056
22505724
22863883
24255178
24778252
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007160  cell-matrix adhesion
GO:0007165  signal transduction

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0004871  signal transducer activity