contactin associated protein 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

CNTNAP1, Neurexin 4, Caspr1, P190, Neurexin IV, contactin associated protein 1, NRXN4, CNTNAP, Caspr, CASPR, p190, Contactin-associated protein 1 precursor

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:34.40 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:224.60 網膜:- 目:76.40 動脈:- 静脈:66.60 リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:51.20 皮膚:52.80
GeneChip 大脳:7.97 小脳:8.11 脳幹:7.88 脳梁:6.53 松果体:- 末梢神経:7.82 脊柱:7.51 網膜:- 目:- 動脈:6.41 静脈:6.65 リンパ節:6.29 末梢血:- 脾臓:6.09 胸腺:5.57 骨髄:6.15 脂肪:6.45 骨:- 皮膚:6.02
CAGE 大脳:4.01 小脳:- 脳幹:2.97 脳梁:2.31 松果体:1.68 末梢神経:- 脊柱:3.76 網膜:- 目:- 動脈:2.05 静脈:1.29 リンパ節:1.27 末梢血:- 脾臓:1.34 胸腺:0.42 骨髄:- 脂肪:0.84 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:4.33 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.96 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.76 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:14.60 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:4.30 心臓:38.30 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:8.50     肝臓:-        肺:14.70    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:8.90 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.77 胎盤:6.37 前立腺:5.82 卵巣:6.15 精巣:5.85 心臓:6.25 骨格筋:6.19 食道:5.83 胃:6.30 腸:5.97 結腸:6.33 肝臓:5.72 肺:5.97 膀胱:- 腎臓:6.15 下垂体:7.14 甲状腺:5.84 副腎:5.88 膵臓:5.59 乳腺:5.91 唾液腺:5.95
CAGE 子宮:2.03 胎盤:0.37 前立腺:1.40 卵巣:1.71 精巣:0.64 心臓:1.50 骨格筋:0.33 食道:1.11 胃:- 腸:1.02 結腸:1.62     肝臓:0    肺:0.61 膀胱:1.68 腎臓:1.01 下垂体:1.13 甲状腺:0.41 副腎:- 膵臓:0.58 乳腺:0.55 唾液腺:0.36
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.09 卵巣:3.28 精巣:1.40 心臓:0.82 骨格筋:0.23 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.77     肝臓:0.22        肺:1.51    膀胱:- 腎臓:1.02 下垂体:- 甲状腺:0.85 副腎:2.42 膵臓:- 乳腺:0.95 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003632
Gene ID 8506
Unigene ID Hs.408730
Probe set ID 219400_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000108797
GTEx ID ENSG00000108797

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_016782
ラット[1]  NM_032061

染色体

17q21.2  [40,834,632  -  40,852,010]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000421  Coagulation factor 5/8 type, C-terminal
IPR008985  Concanavalin A-like lectin/glucanase
IPR013320  Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup
IPR000742  EGF-like, type 3
IPR008979  Galactose-binding domain-like
IPR001791  Laminin G

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
9118959
9407060
9535855
11496158
11839274
12477932
14592966
17474147
19086053
19372141
19423540
20406964
20438785
22190034
22268729
22315232
22360420
23192594
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008088  axon cargo transport
GO:0007411  axon guidance
GO:0007155  cell adhesion
GO:0007010  cytoskeleton organization
GO:0050885  neuromuscular process controlling balance
GO:0050884  neuromuscular process controlling posture
GO:0048812  neuron projection morphogenesis
GO:0030913  paranodal junction assembly
GO:0007165  signal transduction

Cellular Component

GO:0005887  integral to plasma membrane
GO:0033270  paranode region of axon
GO:0008076  voltage-gated potassium channel complex

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0004872  receptor activity
GO:0017124  SH3 domain binding
GO:0005070  SH3/SH2 adaptor activity