carbohydrate (keratan sulfate Gal-6) sulfotransferase 1

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同義遺伝子名

KS6ST, CHST1, Keratan sulfate Gal-6 sulfotransferase, Carbohydrate sulfotransferase 1, KSST, KSGal6ST, GST-1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:54.50 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:112.30 網膜:- 目:47 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:24
GeneChip 大脳:7.52 小脳:5.66 脳幹:7.08 脳梁:6.30 松果体:- 末梢神経:5.07 脊柱:6.36 網膜:- 目:- 動脈:5.74 静脈:5.57 リンパ節:5.46 末梢血:- 脾臓:6.04 胸腺:4.75 骨髄:4.96 脂肪:5.19 骨:- 皮膚:4.70
CAGE 大脳:3.82 小脳:- 脳幹:3.34 脳梁:3.15 松果体:3.20 末梢神経:- 脊柱:2.74 網膜:- 目:- 動脈:2.88 静脈:1.76 リンパ節:1.67 末梢血:- 脾臓:2.28 胸腺:1.22 骨髄:- 脂肪:0.46 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.89 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.70 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.34 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:4.30 心臓:25.50 骨格筋:20.10 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.22 胎盤:4.42 前立腺:4.60 卵巣:6.22 精巣:6.04 心臓:5.36 骨格筋:5.16 食道:5.06 胃:5.02 腸:5.13 結腸:5.58 肝臓:5.14 肺:5.72 膀胱:- 腎臓:5.38 下垂体:6.26 甲状腺:7.19 副腎:5.71 膵臓:5.02 乳腺:5.40 唾液腺:6.37
CAGE 子宮:1.44 胎盤:1.50 前立腺:1.21 卵巣:2.09 精巣:1.62 心臓:1.90 骨格筋:1.91 食道:1.14 胃:- 腸:1.17 結腸:0.95     肝臓:1.12    肺:1.87 膀胱:1.09 腎臓:1.44 下垂体:1.98 甲状腺:3.31 副腎:- 膵臓:0 乳腺:1.92 唾液腺:2.78
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.29 卵巣:1.60 精巣:1.26 心臓:0.43 骨格筋:1.29 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.33     肝臓:0.15        肺:1.01    膀胱:- 腎臓:0.62 下垂体:- 甲状腺:1.86 副腎:0.96 膵臓:- 乳腺:0.38 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003654
Gene ID 8534
Unigene ID Hs.104576
Probe set ID 205567_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000175264
GTEx ID ENSG00000175264

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_023850
ラット[1]  NM_001011955

染色体

11p11.2  [45,670,427  -  45,687,172]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR016469  Carbohydrate sulfotransferase
IPR000863  Sulfotransferase domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1433500
8419650
9117134
9405439
9639683
10049591
10330415
10528213
10642612
11310842
12477932
15324304
15489334
16189514
16344560
16495484
17690104
18698629
18854154
18976975
19343046
21041608
21880669
21988832
22260995

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0005975  carbohydrate metabolic process
GO:0006012  galactose metabolic process
GO:0030203  glycosaminoglycan metabolic process
GO:0006954  inflammatory response
GO:0018146  keratan sulfate biosynthetic process
GO:0042339  keratan sulfate metabolic process
GO:0005976  polysaccharide metabolic process
GO:0006790  sulfur metabolic process

Cellular Component

GO:0000139  Golgi membrane
GO:0016021  integral to membrane

Molecular Function

GO:0045130  keratan sulfotransferase activity
GO:0008146  sulfotransferase activity