synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 1 (C. elegans)

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同義遺伝子名

7h3, SYDE1, FLJ13511

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:7.10

小脳:-

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:35.30

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:18.90

胸腺:12.90

骨髄:-

脂肪:40.30

骨:102.40

皮膚:33.60

GeneChip

大脳:6.47

小脳:6.32

脳幹:6.54

脳梁:6.35

松果体:-

末梢神経:6.63

脊柱:6.43

網膜:-

目:-

動脈:6.89

静脈:6.82

リンパ節:6.42

末梢血:-

脾臓:6.52

胸腺:5.85

骨髄:6.33

脂肪:6.88

骨:-

皮膚:6.60

CAGE

大脳:1.10

小脳:-

脳幹:1.31

脳梁:1.70

松果体:1.25

末梢神経:-

脊柱:1.38

網膜:-

目:-

動脈:3.07

静脈:2.13

リンパ節:1.54

末梢血:-

脾臓:2.17

胸腺:0.54

骨髄:-

脂肪:2.87

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.86

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.84

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.07

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:54.70

胎盤:142.10

前立腺:33.80

卵巣:-

精巣:4.30

心臓:38.30

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:17

肝臓:10.60

肺:24.40

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:8.90

乳腺:9.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.70

胎盤:8.70

前立腺:6.11

卵巣:6.68

精巣:6.13

心臓:6.76

骨格筋:6.52

食道:6.36

胃:6.56

腸:6.60

結腸:6.69

肝臓:6.51

肺:6.42

膀胱:-

腎臓:6.70

下垂体:6.08

甲状腺:6.32

副腎:6.69

膵臓:6.63

乳腺:6.48

唾液腺:6.60

CAGE

子宮:2.77

胎盤:4.12

前立腺:2.67

卵巣:3.02

精巣:1.95

心臓:2.46

骨格筋:1.51

食道:2.55

胃:-

腸:1.71

結腸:1.99

肝臓:1.37

肺:2.10

膀胱:2.70

腎臓:2.15

下垂体:0.32

甲状腺:2.19

副腎:-

膵臓:1.74

乳腺:3.22

唾液腺:0.83

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.17

卵巣:3.67

精巣:2.96

心臓:1.81

骨格筋:0.93

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.82

肝臓:0.88

肺:2.47

膀胱:-

腎臓:2.51

下垂体:-

甲状腺:2.16

副腎:3.17

膵臓:-

乳腺:2.70

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_033025
Gene ID	85360
Unigene ID	Hs.528701
Probe set ID	216272_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000105137
GTEx ID	ENSG00000105137

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_027875
ラット [0]

染色体

19p13.12 [15,218,214 - 15,225,789]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008936	Rho GTPase activation protein
IPR000198	RhoGAP

Link to Pubmed (Pubmed ID)

12477932
14702039
19531213
21139048

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0032862	activation of Rho GTPase activity
GO:0051056	regulation of small GTPase mediated signal transduction
GO:0007264	small GTPase mediated signal transduction

Cellular Component

Molecular Function

Rho GTPase activator activity