patched homolog 2 (Drosophila)

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同義遺伝子名

PTC2, Protein patched homolog 2, patched (Drosophila) homolog 2, PTCH2, patched homolog 2 (Drosophila), UNQ560/PRO1121

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:9.50 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:5.90 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:5.99 小脳:5.93 脳幹:5.94 脳梁:5.77 松果体:- 末梢神経:6.39 脊柱:5.91 網膜:- 目:- 動脈:5.78 静脈:5.91 リンパ節:5.84 末梢血:- 脾臓:5.46 胸腺:5.40 骨髄:5.76 脂肪:5.94 骨:- 皮膚:5.87
CAGE 大脳:2.22 小脳:- 脳幹:1.66 脳梁:1.59 松果体:2.75 末梢神経:- 脊柱:2.76 網膜:- 目:- 動脈:1.79 静脈:1.95 リンパ節:1.33 末梢血:- 脾臓:0.56 胸腺:0.50 骨髄:- 脂肪:0.78 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.22 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:17.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:8.90 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.79 胎盤:5.49 前立腺:5.41 卵巣:5.95 精巣:6.28 心臓:5.70 骨格筋:5.89 食道:5.75 胃:5.95 腸:5.80 結腸:6 肝臓:5.82 肺:5.71 膀胱:- 腎臓:5.73 下垂体:6.24 甲状腺:5.87 副腎:5.87 膵臓:6.20 乳腺:5.67 唾液腺:6.62
CAGE 子宮:2.44 胎盤:0.16 前立腺:1.69 卵巣:3.72 精巣:3.81 心臓:1.00 骨格筋:0.52 食道:1.08 胃:- 腸:0.33 結腸:1.33     肝臓:0.14    肺:0.89 膀胱:1.95 腎臓:0.58 下垂体:2.44 甲状腺:1.25 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0.90 唾液腺:3.34
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.24 精巣:0.74 心臓:0.00 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.04     肝臓:0.00        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.04 下垂体:- 甲状腺:0.02 副腎:0.19 膵臓:- 乳腺:0.14 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001166292
Gene ID 8643
Unigene ID Hs.591497
Probe set ID 221292_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000117425
GTEx ID ENSG00000117425

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_008958
ラット[1]  NM_008958

染色体

1p34.1  [45,285,516  -  45,308,735]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003392  Patched
IPR004766  Transmembrane receptor, patched

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9811851
9931336
10029063
11001584
12477932
12975309
14613484
16710414
17620599
18285427
19208383
19221557
19237606
20301330
20634891
23479190

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008544  epidermis development
GO:0042633  hair cycle
GO:0045879  negative regulation of smoothened signaling pathway

Cellular Component

GO:0016021  integral to membrane

Molecular Function

GO:0008158  hedgehog receptor activity
GO:0005119  smoothened binding