actinin, alpha 1

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同義遺伝子名

Alpha-actinin cytoskeletal isoform, Alpha-actinin-1, actinin, alpha 1, ACTN1, Non-muscle alpha-actinin-1, FLJ40884

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:154.10

小脳:63

脳幹:-

脳梁:787.40

松果体:148.30

末梢神経:153.40

脊柱:224.60

網膜:118.60

目:229.20

動脈:359.70

静脈:66.60

リンパ節:40.40

末梢血:164

脾臓:113.40

胸腺:154.60

骨髄:767.50

脂肪:201.70

骨:281.50

皮膚:259.20

GeneChip

大脳:7.17

小脳:5.60

脳幹:6.23

脳梁:6.16

松果体:-

末梢神経:7.21

脊柱:6.26

網膜:-

目:-

動脈:10.28

静脈:9.50

リンパ節:7.91

末梢血:-

脾臓:7.44

胸腺:6.72

骨髄:8.74

脂肪:8.43

骨:-

皮膚:8.08

CAGE

大脳:4.55

小脳:-

脳幹:3.50

脳梁:3.41

松果体:4.36

末梢神経:-

脊柱:4.61

網膜:-

目:-

動脈:7.18

静脈:5.29

リンパ節:4.77

末梢血:-

脾臓:4.98

胸腺:3.84

骨髄:-

脂肪:5.08

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.83

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:565

胎盤:193.10

前立腺:259.10

卵巣:-

精巣:125.50

心臓:191.60

骨格筋:20.10

食道:342.80

胃:148.70

腸:388.80

結腸:381.60

肝臓:84.40

肺:288.40

膀胱:125.60

腎臓:93.60

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:106.70

乳腺:455.40

唾液腺:328.40

GeneChip

子宮:9.25

胎盤:6.87

前立腺:9.08

卵巣:8.54

精巣:7.03

心臓:7.83

骨格筋:6.40

食道:8.55

胃:8.96

腸:8

結腸:8.44

肝臓:7.75

肺:7.77

膀胱:-

腎臓:6.83

下垂体:6.95

甲状腺:7.04

副腎:7.78

膵臓:7.31

乳腺:8.99

唾液腺:8.35

CAGE

子宮:5.72

胎盤:4.85

前立腺:5.86

卵巣:5.36

精巣:4.46

心臓:5.65

骨格筋:4.01

食道:5.92

胃:-

腸:4.77

結腸:5.63

肝臓:4.90

肺:4.86

膀胱:6.42

腎臓:4.46

下垂体:4.21

甲状腺:3.94

副腎:-

膵臓:4.42

乳腺:5.74

唾液腺:4.80

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.00

卵巣:0.00

精巣:0.00

心臓:0.00

骨格筋:0.26

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.00

肝臓:0.59

肺:0.12

膀胱:-

腎臓:0.04

下垂体:-

甲状腺:0.41

副腎:0.75

膵臓:-

乳腺:0.37

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001130004
Gene ID	87
Unigene ID	Hs.509765
Probe set ID	208637_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000072110
GTEx ID	ENSG00000072110

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_134156
ラット[1]	NM_031005

染色体

14q24.1 [69,340,860 - 69,446,157]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002048	Calcium-binding EF-hand
IPR016146	Calponin-homology
IPR001715	Calponin-like actin-binding
IPR018249	EF-HAND 2
IPR018159	Spectrin/alpha-actinin

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0051764	actin crosslink formation
GO:0051017	actin filament bundle formation
GO:0007596	blood coagulation
GO:0034329	cell junction assembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0048041	focal adhesion formation
GO:0051271	negative regulation of cellular component movement
GO:0030168	platelet activation
GO:0002576	platelet degranulation
GO:0042981	regulation of apoptosis

Cellular Component

GO:0042995	cell projection
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005856	cytoskeleton
GO:0005829	cytosol
GO:0043197	dendritic spine
GO:0005576	extracellular region
GO:0070062	extracellular vesicular exosome
GO:0005916	fascia adherens
GO:0005925	focal adhesion
GO:0005634	nucleus
GO:0005886	plasma membrane
GO:0031093	platelet alpha granule lumen
GO:0031143	pseudopodium
GO:0001726	ruffle
GO:0030018	Z disc

Molecular Function

GO:0051015	actin filament binding
GO:0005509	calcium ion binding
GO:0005178	integrin binding
GO:0005515	protein binding
GO:0019904	protein domain specific binding
GO:0017166	vinculin binding

actinin, alpha 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function