polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1

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同義遺伝子名

PNPase old-35, PNPase, PNPT1, 3'-5' RNA exonuclease OLD35, DKFZp762K1914, old-35, Polynucleotide phosphorylase-like protein, OLD35, PNPASE, PNPase 1, polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:28.40 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:112.30 網膜:237.30 目:29.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:70.80 末梢血:- 脾臓:18.90 胸腺:- 骨髄:78.70 脂肪:121 骨:- 皮膚:28.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.46 小脳:- 脳幹:3.98 脳梁:3.69 松果体:3.21 末梢神経:- 脊柱:3.83 網膜:- 目:- 動脈:2.64 静脈:2.82 リンパ節:2.90 末梢血:- 脾臓:3.15 胸腺:3.24 骨髄:- 脂肪:3.17 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.48 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.19 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.01 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:29.10 前立腺:11.30 卵巣:149.10 精巣:64.90 心臓:25.50 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:59.40     肝臓:-        肺:34.20    膀胱:125.60 腎臓:72.80 下垂体:232 甲状腺:- 副腎:101.60 膵臓:26.70 乳腺:27.90 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.01 胎盤:2.55 前立腺:2.61 卵巣:2.84 精巣:3.14 心臓:3.28 骨格筋:3.32 食道:2.69 胃:- 腸:2.58 結腸:2.37     肝臓:3.26    肺:2.70 膀胱:2.81 腎臓:3.17 下垂体:3.47 甲状腺:2.90 副腎:- 膵臓:3.26 乳腺:2.69 唾液腺:2.95
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.13 卵巣:2.82 精巣:2.55 心臓:2.21 骨格筋:2.30 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.57     肝臓:2.33        肺:1.91    膀胱:- 腎臓:2.45 下垂体:- 甲状腺:3.12 副腎:3.01 膵臓:- 乳腺:2.36 唾液腺:-

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IDs

Refseq ID NM_033109
Gene ID 87178
Unigene ID Hs.388733
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000138035
GTEx ID ENSG00000138035

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_027869
ラット[1]  NM_001142371

染色体

2p16.1  [55,861,400  -  55,921,045]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR004087  K Homology
IPR004088  K Homology, type 1
IPR012340  Nucleic acid-binding, OB-fold
IPR016027  Nucleic acid-binding, OB-fold-like
IPR012162  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase
IPR003029  Ribosomal protein S1, RNA binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

12419256
12473748
12477932
12721301
12798676
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15815621
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16505900
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19509288
19580345
19604093
19864255
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20546612
20547861
20691904
20877624
21151174
21890473
22210891
22586326
22815474
22939629
23084290
23084291
23221631
24143183
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0034599  cellular response to oxidative stress
GO:0000958  mitochondrial mRNA catabolic process
GO:0000965  mitochondrial RNA 3'-end processing
GO:0000964  mitochondrial RNA 5'-end processing
GO:0000957  mitochondrial RNA catabolic process
GO:0070584  mitochondrion morphogenesis
GO:0006402  mRNA catabolic process
GO:0045926  negative regulation of growth
GO:0071042  nuclear polyadenylation-dependent mRNA catabolic process
GO:0000962  positive regulation of mitochondrial RNA catabolic process
GO:0051260  protein homooligomerization
GO:0070207  protein homotrimerization
GO:0043457  regulation of cellular respiration
GO:0006401  RNA catabolic process
GO:0043631  RNA polyadenylation

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0045025  mitochondrial degradosome
GO:0005758  mitochondrial intermembrane space
GO:0005739  mitochondrion
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0000175  3'-5'-exoribonuclease activity
GO:0035198  miRNA binding
GO:0034046  poly(G) RNA binding
GO:0008266  poly(U) RNA binding
GO:0004654  polyribonucleotide nucleotidyltransferase activity
GO:0005515  protein binding