alkB, alkylation repair homolog 1 (E. coli)

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同義遺伝子名

alkB, ALKBH1, ALKBH, hABH, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 1, ABH, alkB, alkylation repair homolog 1 (E. coli)

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:5.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:35.30 動脈:- 静脈:- リンパ節:20.20 末梢血:18.20 脾臓:18.90 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:6.31 小脳:6.60 脳幹:6.21 脳梁:6.52 松果体:- 末梢神経:6.76 脊柱:6.49 網膜:- 目:- 動脈:6.48 静脈:6.54 リンパ節:6.76 末梢血:- 脾臓:6.95 胸腺:6.91 骨髄:6.75 脂肪:6.71 骨:- 皮膚:6.62
CAGE 大脳:1.88 小脳:- 脳幹:1.90 脳梁:2.07 松果体:2.06 末梢神経:- 脊柱:1.74 網膜:- 目:- 動脈:1.85 静脈:2.06 リンパ節:1.76 末梢血:- 脾臓:1.95 胸腺:2.25 骨髄:- 脂肪:1.97 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.44 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.43 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.74 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:14.60 前立腺:- 卵巣:- 精巣:8.70 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:42.50 腸:- 結腸:25.40     肝臓:-        肺:34.20    膀胱:- 腎臓:41.60 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.89 胎盤:6.83 前立腺:6.84 卵巣:6.72 精巣:7.08 心臓:6.85 骨格筋:6.97 食道:6.58 胃:6.78 腸:6.80 結腸:6.56 肝臓:6.30 肺:6.48 膀胱:- 腎臓:6.58 下垂体:6.67 甲状腺:6.71 副腎:6.44 膵臓:6.48 乳腺:6.89 唾液腺:6.62
CAGE 子宮:2.01 胎盤:1.95 前立腺:2.15 卵巣:1.79 精巣:2.35 心臓:1.87 骨格筋:1.98 食道:1.75 胃:- 腸:1.93 結腸:2.20     肝臓:2.01    肺:1.97 膀胱:2.07 腎臓:1.86 下垂体:2.21 甲状腺:2.07 副腎:- 膵臓:2.08 乳腺:2.27 唾液腺:1.58
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.90 卵巣:2.03 精巣:2.68 心臓:2.09 骨格筋:2.39 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.20     肝臓:1.65        肺:2.20    膀胱:- 腎臓:2.06 下垂体:- 甲状腺:1.99 副腎:1.94 膵臓:- 乳腺:1.55 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006020
Gene ID 8846
Unigene ID Hs.94542
Probe set ID 205621_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000100601
GTEx ID ENSG00000100601

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001102565
ラット[1]  NM_001108718

染色体

14q24.3  [78,138,747  -  78,174,363]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8600462
12477932
12508121
12594517
15489334
18163532
18603530
19959401
21906983
21956739
22872573
23577621
23825659

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0048589  developmental growth
GO:0006307  DNA dealkylation
GO:0080111  DNA demethylation
GO:0006281  DNA repair
GO:0001701  in utero embryonic development
GO:0043524  negative regulation of neuron apoptosis
GO:0001764  neuron migration
GO:0031175  neuron projection development
GO:0070989  oxidative demethylation
GO:0001890  placenta development
GO:0042245  RNA repair

Cellular Component

GO:0005739  mitochondrion
GO:0005719  nuclear euchromatin

Molecular Function

GO:0042056  chemoattractant activity
GO:0003906  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase activity
GO:0008198  ferrous iron binding
GO:0070579  methylcytosine dioxygenase activity
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen