LIM domain binding 1

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同義遺伝子名

CLIM-2, LDB1, CLIM2, LIM domain-binding factor CLIM2, LIM domain binding 1, NLI, LIM domain-binding protein 1, Carboxyl-terminal LIM domain-binding protein 2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:15.40 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:23.50 動脈:30 静脈:- リンパ節:101.10 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:38.70 骨髄:118.10 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:33.60
GeneChip 大脳:6.77 小脳:6.47 脳幹:6.77 脳梁:6.66 松果体:- 末梢神経:6.66 脊柱:6.57 網膜:- 目:- 動脈:6.83 静脈:6.87 リンパ節:7.41 末梢血:- 脾臓:7.64 胸腺:6.90 骨髄:7.47 脂肪:7.01 骨:- 皮膚:7.47
CAGE 大脳:4.31 小脳:- 脳幹:4.12 脳梁:4.38 松果体:4.06 末梢神経:- 脊柱:3.96 網膜:- 目:- 動脈:4.42 静脈:4.24 リンパ節:4.25 末梢血:- 脾臓:3.98 胸腺:4.21 骨髄:- 脂肪:3.49 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.22 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.27 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.24 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:45.60 胎盤:10.90 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:34.60 心臓:89.40 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:- 結腸:25.40     肝臓:-        肺:24.40    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:35.60 乳腺:37.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.18 胎盤:7.22 前立腺:7.06 卵巣:7.26 精巣:7.04 心臓:6.99 骨格筋:6.83 食道:7.46 胃:7.16 腸:6.87 結腸:6.80 肝臓:6.97 肺:6.92 膀胱:- 腎臓:7.18 下垂体:7.12 甲状腺:7.26 副腎:7.17 膵臓:6.69 乳腺:7.38 唾液腺:7.32
CAGE 子宮:4.48 胎盤:3.92 前立腺:4.37 卵巣:4.28 精巣:3.96 心臓:3.83 骨格筋:3.69 食道:3.96 胃:- 腸:3.55 結腸:4.00     肝臓:3.02    肺:3.98 膀胱:4.08 腎臓:3.78 下垂体:3.66 甲状腺:3.98 副腎:- 膵臓:3.52 乳腺:3.62 唾液腺:4.54
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.46 卵巣:1.08 精巣:1.80 心臓:0.11 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.13     肝臓:0.00        肺:0.46    膀胱:- 腎臓:0.16 下垂体:- 甲状腺:0.92 副腎:0.37 膵臓:- 乳腺:0.44 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003893
Gene ID 8861
Unigene ID Hs.454418
Probe set ID 35160_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000198728
GTEx ID ENSG00000198728

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001113408, NM_010697
ラット[1]  NM_001107601, NM_010697

染色体

10q24.32  [103,867,317  -  103,880,210]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9209374
9214632
9315627
9391090
9452425
9503020
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10866689
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12642495
12727888
12792813
12874135
12925972
14743429
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15231748
15489334
16189514
16314316
16385451
16407974
16713569
16815859
17437998
17910069
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19117995
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20423330
20447379
20603019
21139048
21988832
22010104
23000965
23812588

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0009948  anterior/posterior axis specification
GO:0022607  cellular component assembly
GO:0021702  cerebellar Purkinje cell differentiation
GO:0010669  epithelial structure maintenance
GO:0001702  gastrulation with mouth forming second
GO:0001942  hair follicle development
GO:0060322  head development
GO:0043973  histone H3-K4 acetylation
GO:0007275  multicellular organismal development
GO:0045647  negative regulation of erythrocyte differentiation
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0030182  neuron differentiation
GO:0045785  positive regulation of cell adhesion
GO:0046985  positive regulation of hemoglobin biosynthetic process
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0032784  regulation of RNA elongation
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0035019  somatic stem cell maintenance
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351  transcription, DNA-dependent
GO:0000972  transcription-dependent tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery
GO:0016055  Wnt receptor signaling pathway

Cellular Component

GO:0005911  cell-cell junction
GO:0000790  nuclear chromatin
GO:0005634  nucleus
GO:0043234  protein complex
GO:0005667  transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0019899  enzyme binding
GO:0030274  LIM domain binding
GO:0042803  protein homodimerization activity
GO:0043621  protein self-association
GO:0003714  transcription corepressor activity