synaptojanin 2

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同義遺伝子名

KIAA0348, INPP5H, synaptojanin 2, Synaptojanin-2, SYNJ2, MGC44422

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:96 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:87.50 松果体:148.30 末梢神経:92 脊柱:- 網膜:- 目:17.60 動脈:89.90 静脈:- リンパ節:80.90 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:78.70 脂肪:- 骨:25.60 皮膚:52.80
GeneChip 大脳:6.85 小脳:6.93 脳幹:7.02 脳梁:7.28 松果体:- 末梢神経:5.84 脊柱:6.91 網膜:- 目:- 動脈:6.24 静脈:6.84 リンパ節:6.36 末梢血:- 脾臓:6.08 胸腺:5.93 骨髄:6.52 脂肪:6.24 骨:- 皮膚:5.96
CAGE 大脳:3.24 小脳:- 脳幹:4.65 脳梁:4.86 松果体:0.62 末梢神経:- 脊柱:4.61 網膜:- 目:- 動脈:3.01 静脈:1.69 リンパ節:2.04 末梢血:- 脾臓:1.56 胸腺:2.07 骨髄:- 脂肪:1.21 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.13 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.85 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.46 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:45.60 胎盤:3.60 前立腺:33.80 卵巣:111.80 精巣:51.90 心臓:63.90 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:129.60 結腸:152.60     肝臓:31.70        肺:53.80    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:163.70 副腎:- 膵臓:80 乳腺:55.80 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.35 胎盤:5.97 前立腺:5.72 卵巣:6.54 精巣:5.62 心臓:6.81 骨格筋:6.91 食道:6.53 胃:6.51 腸:6.55 結腸:7.13 肝臓:6.52 肺:6.48 膀胱:- 腎臓:6.43 下垂体:6.25 甲状腺:5.92 副腎:6.44 膵臓:6.84 乳腺:6.44 唾液腺:6.85
CAGE 子宮:2.08 胎盤:1.84 前立腺:2.07 卵巣:1.67 精巣:0.84 心臓:1.84 骨格筋:1.43 食道:1.86 胃:- 腸:2.29 結腸:2.63     肝臓:1.54    肺:1.51 膀胱:2.27 腎臓:1.30 下垂体:1.62 甲状腺:1.90 副腎:- 膵臓:2.26 乳腺:1.92 唾液腺:2.01
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.91 卵巣:0.56 精巣:0.33 心臓:0.60 骨格筋:0.52 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.24     肝臓:0.38        肺:0.64    膀胱:- 腎臓:0.25 下垂体:- 甲状腺:1.75 副腎:1.61 膵臓:- 乳腺:0.91 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003898
Gene ID 8871
Unigene ID Hs.434494
Probe set ID 216180_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000078269
GTEx ID ENSG00000078269

オーソログ対応遺伝子

マウス[15]  NM_001113351, NM_001113352, NM_001113353, NM_011523
ラット[3]  NM_001113371, NM_001113372, NM_032071, NM_011523

染色体

6q25.3  [158,402,888  -  158,520,208]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR005135  Endonuclease/exonuclease/phosphatase
IPR000300  Inositol polyphosphate related phosphatase
IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9205841
9388224
10357812
10805734
11084340
11498538
12421765
12456676
12477932
12699622
12805586
14562116
14574404
15090612
15489334
15548694
15778465
16102578
16344560
17474147
17562712
19531213
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21555518
21890473
21906983
22045296
22213687
22558309
22823124
23076136
23300701
24077433
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006661  phosphatidylinositol biosynthetic process
GO:0046856  phosphoinositide dephosphorylation
GO:0006644  phospholipid metabolic process

Cellular Component

GO:0005829  cytosol
GO:0016020  membrane

Molecular Function

GO:0000166  nucleotide binding
GO:0004439  phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 5-phosphatase activity
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding