sarcoglycan, epsilon

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同義遺伝子名

SGCE, sarcoglycan, epsilon, Epsilon-SG, DYT11, Epsilon-sarcoglycan precursor

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:49.80

小脳:-

脳幹:6535.90

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:122.70

脊柱:112.30

網膜:-

目:41.10

動脈:209.80

静脈:-

リンパ節:30.30

末梢血:-

脾臓:18.90

胸腺:25.80

骨髄:-

脂肪:40.30

骨:-

皮膚:14.40

GeneChip

大脳:6.87

小脳:6.77

脳幹:7.10

脳梁:7.41

松果体:-

末梢神経:8.15

脊柱:7.39

網膜:-

目:-

動脈:7.34

静脈:7.54

リンパ節:5.99

末梢血:-

脾臓:7.03

胸腺:6.06

骨髄:4.40

脂肪:7.49

骨:-

皮膚:6.32

CAGE

大脳:3.05

小脳:-

脳幹:3.30

脳梁:3.25

松果体:2.78

末梢神経:-

脊柱:3.04

網膜:-

目:-

動脈:3.55

静脈:3.03

リンパ節:2.19

末梢血:-

脾臓:2.78

胸腺:1.56

骨髄:-

脂肪:2.94

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.02

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.22

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:27.30

胎盤:54.60

前立腺:11.30

卵巣:74.50

精巣:43.30

心臓:51.10

骨格筋:-

食道:-

胃:21.20

腸:64.80

結腸:33.90

肝臓:10.60

肺:14.70

膀胱:125.60

腎臓:52

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:253.90

膵臓:44.50

乳腺:9.30

唾液腺:328.40

GeneChip

子宮:7.55

胎盤:7.71

前立腺:7.10

卵巣:8.26

精巣:6.96

心臓:7.12

骨格筋:5.72

食道:5.91

胃:6.86

腸:6.86

結腸:6.68

肝臓:5.28

肺:7.26

膀胱:-

腎臓:6.24

下垂体:6.89

甲状腺:6.87

副腎:7.78

膵臓:6.38

乳腺:7.21

唾液腺:6.67

CAGE

子宮:3.44

胎盤:3.46

前立腺:3.24

卵巣:3.77

精巣:3.11

心臓:2.85

骨格筋:1.87

食道:2.87

胃:-

腸:2.15

結腸:2.66

肝臓:1.79

肺:2.85

膀胱:3.51

腎臓:2.66

下垂体:3.42

甲状腺:2.75

副腎:-

膵臓:2.34

乳腺:3.19

唾液腺:2.39

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.06

卵巣:0.00

精巣:0.00

心臓:0.00

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.12

肝臓:0.00

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.00

下垂体:-

甲状腺:0.00

副腎:0.05

膵臓:-

乳腺:0.00

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001099401
Gene ID	8910
Unigene ID	Hs.371199
Probe set ID	204688_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000127990
GTEx ID	ENSG00000127990

オーソログ対応遺伝子

マウス[5]	NM_001130188, NM_001130189, NM_001130190, NM_001130191, NM_011360
ラット[5]	NM_001130188, NM_001130189, NM_001130190, NM_001130191, NM_011360

染色体

7q21.3 [94,214,542 - 94,285,521]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR015919	Cadherin-like
IPR006644	Dystroglycan-type cadherin-like

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007160	cell-matrix adhesion
GO:0007517	muscle organ development

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005856	cytoskeleton
GO:0016010	dystrophin-associated glycoprotein complex
GO:0005887	integral to plasma membrane
GO:0016012	sarcoglycan complex
GO:0042383	sarcolemma

Molecular Function

GO:0005509

calcium ion binding

sarcoglycan, epsilon

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function