LIM domains containing 1

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同義遺伝子名

LIM domain-containing protein 1, LIM domains containing 1, LIMD1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:5.47 小脳:5.52 脳幹:5.44 脳梁:5.63 松果体:- 末梢神経:6.06 脊柱:5.68 網膜:- 目:- 動脈:5.90 静脈:5.61 リンパ節:5.80 末梢血:- 脾臓:6.16 胸腺:6.38 骨髄:6.10 脂肪:5.83 骨:- 皮膚:5.78
CAGE 大脳:2.40 小脳:- 脳幹:3.01 脳梁:3.05 松果体:2.94 末梢神経:- 脊柱:3.11 網膜:- 目:- 動脈:4.16 静脈:3.61 リンパ節:3.86 末梢血:- 脾臓:3.64 胸腺:3.69 骨髄:- 脂肪:3.44 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.13 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.44 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.50 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.83 胎盤:6.17 前立腺:6.02 卵巣:5.61 精巣:5.43 心臓:5.91 骨格筋:5.96 食道:5.83 胃:5.80 腸:5.86 結腸:6.21 肝臓:5.95 肺:5.88 膀胱:- 腎臓:5.66 下垂体:5.85 甲状腺:6.01 副腎:5.59 膵臓:6.08 乳腺:5.55 唾液腺:6.12
CAGE 子宮:3.45 胎盤:3.49 前立腺:3.44 卵巣:2.93 精巣:2.84 心臓:3.50 骨格筋:3.56 食道:3.24 胃:- 腸:3.04 結腸:3.69     肝臓:3.41    肺:4.21 膀胱:3.45 腎臓:3.01 下垂体:2.79 甲状腺:3.69 副腎:- 膵臓:3.95 乳腺:3.54 唾液腺:3.59
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.53 卵巣:2.73 精巣:2.14 心臓:2.70 骨格筋:3.63 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.35     肝臓:3.04        肺:3.77    膀胱:- 腎臓:2.45 下垂体:- 甲状腺:4.07 副腎:2.58 膵臓:- 乳腺:2.32 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_014240
Gene ID 8994
Unigene ID Hs.621057
Probe set ID 218850_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000144791
GTEx ID ENSG00000144791

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_013860
ラット[1]  NM_001112737

染色体

3p21.31  [45,596,886  -  45,727,830]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10647888
11158571
11352561
12477932
14702039
15144186
15231748
15489334
15542589
15870274
17889706
18439753
18654987
18712738
19060205
20133701
20226061
21402070
21832049
22118674
22190034
22286099
22863883
22939629
24255178
24654937

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016477  cell migration
GO:0033962  cytoplasmic mRNA processing body assembly
GO:0007010  cytoskeleton organization
GO:0035195  gene silencing by miRNA
GO:0007275  multicellular organismal development
GO:0045668  negative regulation of osteoblast differentiation
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0090090  negative regulation of Wnt receptor signaling pathway through beta-catenin
GO:0002076  osteoblast development
GO:0016310  phosphorylation
GO:0008360  regulation of cell shape
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0001666  response to hypoxia
GO:0007165  signal transduction
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005912  adherens junction
GO:0005737  cytoplasm
GO:0000932  cytoplasmic mRNA processing body
GO:0005925  focal adhesion
GO:0005634  nucleus
GO:0016442  RNA-induced silencing complex

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0003714  transcription corepressor activity
GO:0008270  zinc ion binding