sema domain, seven thrombospondin repeats (type 1 and type 1-like), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 5A

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

semF, Semaphorin-5A precursor, Semaphorin F, Sema F, SEMAF, SEMA5A

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:17.80 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:184 脊柱:- 網膜:- 目:35.30 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:18.90 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:- 皮膚:9.60
GeneChip 大脳:6.33 小脳:5.56 脳幹:6.22 脳梁:6.85 松果体:- 末梢神経:7.02 脊柱:6.70 網膜:- 目:- 動脈:6.14 静脈:6.28 リンパ節:6.49 末梢血:- 脾臓:6.49 胸腺:4.91 骨髄:4.82 脂肪:6.61 骨:- 皮膚:5.86
CAGE 大脳:2.60 小脳:- 脳幹:2.78 脳梁:3.10 松果体:1.83 末梢神経:- 脊柱:3.30 網膜:- 目:- 動脈:3.06 静脈:2.85 リンパ節:2.70 末梢血:- 脾臓:1.69 胸腺:0.94 骨髄:- 脂肪:1.86 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.52 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.83 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.66 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:82 胎盤:18.20 前立腺:33.80 卵巣:- 精巣:- 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:8.50     肝臓:-        肺:19.60    膀胱:- 腎臓:62.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:35.60 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.15 胎盤:6.30 前立腺:6.23 卵巣:5.81 精巣:4.68 心臓:6.64 骨格筋:5.70 食道:5.79 胃:5.65 腸:5.78 結腸:6.35 肝臓:5.92 肺:7.21 膀胱:- 腎臓:6.83 下垂体:5.94 甲状腺:5.52 副腎:5.56 膵臓:5.91 乳腺:7.12 唾液腺:6.10
CAGE 子宮:3.00 胎盤:2.77 前立腺:2.06 卵巣:1.58 精巣:1.45 心臓:3.14 骨格筋:0.93 食道:2.38 胃:- 腸:2.34 結腸:2.99     肝臓:1.29    肺:3.41 膀胱:2.23 腎臓:2.39 下垂体:2.67 甲状腺:1.02 副腎:- 膵臓:1.42 乳腺:3.16 唾液腺:1.49
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.03 卵巣:1.41 精巣:1.71 心臓:3.00 骨格筋:0.43 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.54     肝臓:0.67        肺:2.96    膀胱:- 腎臓:3.04 下垂体:- 甲状腺:0.83 副腎:2.63 膵臓:- 乳腺:2.29 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003966
Gene ID 9037
Unigene ID Hs.27621
Probe set ID 213169_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000112902
GTEx ID ENSG00000112902

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_009154
ラット[1]  NM_001107659

染色体

5p15.31  [9,035,138  -  9,546,187]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003659  Plexin/semaphorin/integrin
IPR001627  Semaphorin/CD100 antigen
IPR000884  Thrombospondin, type 1 repeat
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8817451
8889548
9049630
9464278
12477932
14702039
15218527
15302935
15372022
15489334
16252231
16344560
16481103
17028446
18029348
18519826
18628988
18950607
19329067
19812673
19913121
19957501
20073063
20379614
20628086
20696765
20802022
21706053
21890473
22229870
22782341
22821546
23251661
24722188

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007411  axon guidance
GO:0007155  cell adhesion
GO:0007267  cell-cell signaling
GO:0007399  nervous system development
GO:0001569  patterning of blood vessels

Cellular Component

GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0008046  axon guidance receptor activity