PDZ and LIM domain 1

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同義遺伝子名

hCLIM1, PDLIM1, PDZ and LIM domain protein 1, CLP36, CLIM1, CLP-36, Elfin, PDZ and LIM domain 1 (elfin), C-terminal LIM domain protein 1, ELFIN, LIM domain protein CLP-36

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:16.60 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:148.30 末梢神経:92 脊柱:112.30 網膜:237.30 目:158.70 動脈:179.90 静脈:399.90 リンパ節:- 末梢血:18.20 脾臓:113.40 胸腺:38.70 骨髄:- 脂肪:403.30 骨:- 皮膚:240
GeneChip 大脳:5.49 小脳:5.15 脳幹:5.67 脳梁:5.51 松果体:- 末梢神経:8.23 脊柱:6.83 網膜:- 目:- 動脈:10.22 静脈:10.27 リンパ節:9.65 末梢血:- 脾臓:9.70 胸腺:9.21 骨髄:7.92 脂肪:9.71 骨:- 皮膚:9.58
CAGE 大脳:2.13 小脳:- 脳幹:2.53 脳梁:2.26 松果体:4.22 末梢神経:- 脊柱:3.44 網膜:- 目:- 動脈:6.02 静脈:5.35 リンパ節:5.35 末梢血:- 脾臓:5.18 胸腺:4.21 骨髄:- 脂肪:5.36 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.38 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:7.22 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:7.38 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:182.30 胎盤:360.70 前立腺:78.90 卵巣:111.80 精巣:17.30 心臓:127.70 骨格筋:421.90 食道:- 胃:63.70 腸:226.80 結腸:271.30     肝臓:73.90        肺:259    膀胱:- 腎臓:93.60 下垂体:- 甲状腺:818.70 副腎:50.80 膵臓:106.70 乳腺:83.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:9.35 胎盤:8.93 前立腺:8.95 卵巣:9.06 精巣:6.95 心臓:10.21 骨格筋:9.84 食道:10.32 胃:9.49 腸:10.21 結腸:10.29 肝臓:8.98 肺:10.35 膀胱:- 腎臓:7.91 下垂体:6.21 甲状腺:9.98 副腎:8.24 膵臓:9.01 乳腺:9.96 唾液腺:9.46
CAGE 子宮:4.74 胎盤:5.12 前立腺:4.85 卵巣:4.37 精巣:3.45 心臓:5.74 骨格筋:6.18 食道:5.12 胃:- 腸:5.78 結腸:5.76     肝臓:4.97    肺:5.63 膀胱:5.41 腎臓:4.19 下垂体:2.98 甲状腺:5.51 副腎:- 膵臓:4.09 乳腺:5.55 唾液腺:4.82
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:6.80 卵巣:5.10 精巣:5.57 心臓:6.95 骨格筋:7.36 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:6.94     肝臓:5.68        肺:8.95    膀胱:- 腎臓:5.25 下垂体:- 甲状腺:6.88 副腎:8.01 膵臓:- 乳腺:6.44 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_020992
Gene ID 9124
Unigene ID Hs.368525
Probe set ID 208690_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000107438
GTEx ID ENSG00000107438

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_016861
ラット [0]  

染色体

10q24.1  [96,997,329  -  97,050,781]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8522188
10022510
10753915
10861853
11110697
11882901
11973348
12464179
12477932
12665801
15144186
15164054
15489334
15592455
16169070
16189514
16385451
16609848
17213842
19117995
21041247
21139048
21651830
21680739
21890473
21900206
22851037
22863883
22922308
22939629
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0001666  response to hypoxia
GO:0006979  response to oxidative stress

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005856  cytoskeleton
GO:0005667  transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003713  transcription coactivator activity
GO:0008270  zinc ion binding