structural maintenance of chromosomes 3

同義遺伝子名

Chromosome-associated polypeptide, Chondroitin sulfate proteoglycan 6, BMH, Structural maintenance of chromosome 3, HCAP, chondroitin sulfate proteoglycan 6 (bamacan), BAM, SMC3L1, CSPG6, SMC3, Bamacan, structural maintenance of chromosomes 3, hCAP

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:51

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:-

目:23.50

動脈:-

静脈:-

リンパ節:111.20

末梢血:36.40

脾臓:-

胸腺:38.70

骨髄:39.40

脂肪:80.70

骨:38.40

皮膚:28.80

GeneChip

大脳:5.29

小脳:5.66

脳幹:5.16

脳梁:5.63

松果体:-

末梢神経:5.79

脊柱:4.89

網膜:-

目:-

動脈:5.17

静脈:5.32

リンパ節:6.38

末梢血:-

脾臓:6.56

胸腺:7.52

骨髄:6.06

脂肪:5.05

骨:-

皮膚:4.81

CAGE

大脳:3.04

小脳:-

脳幹:3.19

脳梁:2.63

松果体:3.68

末梢神経:-

脊柱:3.38

網膜:-

目:-

動脈:2.55

静脈:2.60

リンパ節:2.82

末梢血:-

脾臓:3.15

胸腺:3.93

骨髄:-

脂肪:3.13

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.59

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.46

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.12

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:45.60

胎盤:25.50

前立腺:56.30

卵巣:37.30

精巣:86.50

心臓:12.80

骨格筋:40.20

食道:-

胃:-

腸:32.40

結腸:25.40

肝臓:95

肺:19.60

膀胱:251.20

腎臓:93.60

下垂体:347.90

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:44.50

乳腺:18.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.20

胎盤:6.03

前立腺:5.46

卵巣:6.57

精巣:6.60

心臓:5.78

骨格筋:4.78

食道:5.85

胃:5.82

腸:5.12

結腸:4.54

肝臓:6.07

肺:6

膀胱:-

腎臓:5.12

下垂体:4.99

甲状腺:5.79

副腎:6.24

膵臓:5.17

乳腺:5.41

唾液腺:5.41

CAGE

子宮:2.93

胎盤:3.31

前立腺:3.02

卵巣:3.53

精巣:3.36

心臓:2.79

骨格筋:2.74

食道:3.24

胃:-

腸:3.18

結腸:2.62

肝臓:2.93

肺:2.87

膀胱:3.29

腎臓:3.04

下垂体:3.63

甲状腺:3.15

副腎:-

膵臓:2.66

乳腺:3.27

唾液腺:1.75

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.82

卵巣:4.76

精巣:5.84

心臓:3.01

骨格筋:3.53

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.19

肝臓:2.42

肺:3.12

膀胱:-

腎臓:3.64

下垂体:-

甲状腺:4.36

副腎:4.12

膵臓:-

乳腺:3.61

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005445
Gene ID	9126
Unigene ID	Hs.24485
Probe set ID	209258_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000108055
GTEx ID	ENSG00000108055

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_007790
ラット [0]

染色体

10q25.2 [112,327,449 - 112,364,394]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0000910	cytokinesis
GO:0006281	DNA repair
GO:0007126	meiosis
GO:0007067	mitosis
GO:0000278	mitotic cell cycle
GO:0007052	mitotic spindle organization
GO:0032876	negative regulation of DNA endoreduplication
GO:0006275	regulation of DNA replication
GO:0007165	signal transduction
GO:0007062	sister chromatid cohesion
GO:0019827	stem cell maintenance

Cellular Component

GO:0005604	basement membrane
GO:0000785	chromatin
GO:0005694	chromosome
GO:0000775	chromosome, centromeric region
GO:0008278	cohesin complex
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0000800	lateral element
GO:0030893	meiotic cohesin complex
GO:0016363	nuclear matrix
GO:0034991	nuclear meiotic cohesin complex
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0000922	spindle pole

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0003682	chromatin binding
GO:0045502	dynein binding
GO:0003777	microtubule motor activity
GO:0005515	protein binding
GO:0046982	protein heterodimerization activity

structural maintenance of chromosomes 3

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function