synaptogyrin 3

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同義遺伝子名

MGC:20003, Synaptogyrin-3, SYNGR3, synaptogyrin 3

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:88.90

小脳:113.30

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:786.10

網膜:-

目:41.10

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:8.90

小脳:8.57

脳幹:9.59

脳梁:5.43

松果体:-

末梢神経:9.34

脊柱:7.18

網膜:-

目:-

動脈:4.87

静脈:4.82

リンパ節:5.27

末梢血:-

脾臓:4.67

胸腺:4.69

骨髄:4.61

脂肪:4.68

骨:-

皮膚:4.89

CAGE

大脳:3.93

小脳:-

脳幹:3.23

脳梁:2.61

松果体:0.62

末梢神経:-

脊柱:2.34

網膜:-

目:-

動脈:0.47

静脈:1.03

リンパ節:1.76

末梢血:-

脾臓:0.76

胸腺:0.23

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.84

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.91

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.08

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:29.10

前立腺:22.50

卵巣:-

精巣:8.70

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:8.90

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.33

胎盤:7.18

前立腺:4.44

卵巣:4.43

精巣:6.27

心臓:4.57

骨格筋:4.58

食道:4.78

胃:4.79

腸:4.93

結腸:5.34

肝臓:4.59

肺:4.69

膀胱:-

腎臓:4.81

下垂体:6.17

甲状腺:4.60

副腎:5.21

膵臓:4.58

乳腺:4.52

唾液腺:4.70

CAGE

子宮:0.04

胎盤:3.08

前立腺:0.53

卵巣:0.07

精巣:0.80

心臓:0.25

骨格筋:0.30

食道:0.46

胃:-

腸:1.07

結腸:1.59

肝臓:0.26

肺:0.56

膀胱:0.46

腎臓:0.71

下垂体:1.75

甲状腺:0

副腎:-

膵臓:0.58

乳腺:0

唾液腺:0.62

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.68

卵巣:0.30

精巣:1.85

心臓:0.19

骨格筋:0.07

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.18

肝臓:0.04

肺:0.47

膀胱:-

腎臓:0.90

下垂体:-

甲状腺:0.11

副腎:0.67

膵臓:-

乳腺:0.04

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_004209
Gene ID	9143
Unigene ID	Hs.435277
Probe set ID	205691_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000127561
GTEx ID	ENSG00000127561

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_011522
ラット[1]	NM_001106985

染色体

16p13.3 [2,039,946 - 2,044,276]

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遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008253	Marvel
IPR021128	MARVEL-like domain
IPR016579	Synaptogyrin

Link to Pubmed (Pubmed ID)

9760194
12477932
14755516
15489334
19357284
20224928
21139048
23864651

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

positive regulation of transporter activity

Cellular Component

GO:0030054	cell junction
GO:0016021	integral to membrane
GO:0031594	neuromuscular junction
GO:0008021	synaptic vesicle

Molecular Function

GO:0047485	protein N-terminus binding
GO:0042169	SH2 domain binding